161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0039 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  100 
 
 
233 aa  466  9.999999999999999e-131  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  72.64 
 
 
202 aa  296  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0837  transcriptional regulator, TetR family  54.64 
 
 
238 aa  194  8.000000000000001e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.895795  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_10310  transcriptional regulator, tetR family  48.19 
 
 
230 aa  149  5e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  40.36 
 
 
243 aa  145  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  31.86 
 
 
202 aa  94  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 
211 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1632  Tetracyclin repressor domain protein  33.33 
 
 
207 aa  89.7  3e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.0188717 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  33.17 
 
 
250 aa  88.6  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0832  Tetracyclin repressor domain protein  34.5 
 
 
204 aa  87.8  1e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  33.68 
 
 
212 aa  82  0.000000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 
218 aa  81.6  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 
218 aa  74.7  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 
224 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  28.22 
 
 
218 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 
259 aa  65.1  0.0000000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  30.07 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.82 
 
 
222 aa  62.8  0.000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  27.35 
 
 
259 aa  62  0.000000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  27.04 
 
 
266 aa  61.6  0.000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  25.1 
 
 
271 aa  61.6  0.00000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 
245 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 
223 aa  61.2  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 
224 aa  60.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
224 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  27.75 
 
 
227 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 
259 aa  58.9  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  25.59 
 
 
221 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 
218 aa  58.9  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 
222 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 
242 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  27.32 
 
 
228 aa  58.2  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  26.78 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4082  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
343 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.63573 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  29.44 
 
 
239 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  28.4 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  28.93 
 
 
190 aa  57  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 
249 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 
239 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  25.66 
 
 
210 aa  56.6  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  24.66 
 
 
234 aa  55.1  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  30.52 
 
 
244 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
183 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  26.82 
 
 
238 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 
212 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 
304 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  25.64 
 
 
210 aa  53.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
223 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3042  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 
202 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.578311 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  25.58 
 
 
221 aa  52  0.000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  24.55 
 
 
267 aa  52.4  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  28.97 
 
 
211 aa  52  0.000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 
246 aa  52  0.000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 
315 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 
207 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  25.17 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4763  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.0000323039  decreased coverage  0.0000700922 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  37.62 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  50.91 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 
268 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  27.91 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  27.91 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  27.91 
 
 
225 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3085  regulatory protein, TetR  29.93 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.355286  normal  0.26404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
250 aa  49.7  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 
221 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
200 aa  49.3  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 
253 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 
206 aa  49.3  0.00006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 
233 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 
272 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 
235 aa  48.5  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 
220 aa  48.5  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3340  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 
227 aa  48.1  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
212 aa  48.1  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  41.54 
 
 
235 aa  48.1  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
223 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 
218 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 
214 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  24.9 
 
 
246 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  26.57 
 
 
229 aa  47  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  29.37 
 
 
223 aa  47  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  28.37 
 
 
263 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  26.2 
 
 
256 aa  46.6  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 
250 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 
249 aa  46.2  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  24.24 
 
 
260 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 
192 aa  46.2  0.0005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>