More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1945 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 268 aa  543  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 249 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 272 aa  165  6.9999999999999995e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  37.83 
 
 		 234 aa  142  4e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 228 aa  140  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  37.39 
 
 		 249 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  36.64 
 
 		 250 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  38.36 
 
 		 226 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  44.1 
 
 		 240 aa  122  6e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 234 aa  121  9.999999999999999e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  34.6 
 
 		 229 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  37.79 
 
 		 223 aa  110  2.0000000000000002e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  30.15 
 
 		 272 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 229 aa  107  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 230 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  41.61 
 
 		 257 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  42.28 
 
 		 231 aa  105  5e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 224 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 242 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 283 aa  103  3e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 253 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 225 aa  101  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  32.82 
 
 		 271 aa  100  2e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  35.94 
 
 		 218 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 228 aa  99.4  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 248 aa  99.4  5e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 259 aa  99.8  5e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 226 aa  99  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 265 aa  98.2  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  32.59 
 
 		 222 aa  97.8  2e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 263 aa  97.1  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 224 aa  95.9  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  33.03 
 
 		 223 aa  95.9  7e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 250 aa  95.1  9e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  30.43 
 
 		 247 aa  94.7  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 239 aa  94  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  33.74 
 
 		 253 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 272 aa  93.2  4e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  34.88 
 
 		 315 aa  92.4  7e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  35.21 
 
 		 342 aa  90.9  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 221 aa  91.3  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  30.67 
 
 		 236 aa  90.5  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 		 269 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 238 aa  90.1  3e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 		 266 aa  89.4  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 223 aa  89.4  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29.78 
 
 		 247 aa  88.2  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  35.11 
 
 		 293 aa  88.6  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  30.47 
 
 		 260 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  35.16 
 
 		 223 aa  87.8  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  33.52 
 
 		 222 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  34.09 
 
 		 343 aa  87  3e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  41.6 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 206 aa  86.7  4e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 218 aa  84.3  0.000000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 235 aa  84  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 241 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  27.31 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  37.4 
 
 		 221 aa  82.8  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  30.41 
 
 		 239 aa  82.8  0.000000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 278 aa  82.8  0.000000000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 250 aa  82.4  0.000000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 285 aa  82.4  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 268 aa  82.4  0.000000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  29.88 
 
 		 247 aa  82.4  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  28.68 
 
 		 267 aa  82.4  0.000000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2879  regulatory protein TetR  37.5 
 
 		 226 aa  81.6  0.00000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  28.63 
 
 		 262 aa  82  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  32.31 
 
 		 228 aa  80.9  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  28.51 
 
 		 253 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 255 aa  80.5  0.00000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 330 aa  80.1  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 264 aa  79.7  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 244 aa  79.7  0.00000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 210 aa  79.3  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  44.95 
 
 		 272 aa  79  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  30.18 
 
 		 211 aa  78.6  0.00000000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 213 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  32.65 
 
 		 232 aa  78.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 315 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 230 aa  77.8  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 249 aa  77.8  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  29.74 
 
 		 246 aa  77.8  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  28.76 
 
 		 261 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  29.09 
 
 		 230 aa  76.6  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 267 aa  76.6  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6384  putative transcriptional regulator, TetR family  36.48 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.317451  normal  0.404992 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 258 aa  75.9  0.0000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  34.08 
 
 		 221 aa  75.5  0.0000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 268 aa  75.5  0.0000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  30.22 
 
 		 241 aa  75.1  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>