248 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_4845 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 230 aa  451  1.0000000000000001e-126  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  61.14 
 
 		 226 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  50.89 
 
 		 247 aa  215  4e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 272 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  40.6 
 
 		 272 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 229 aa  135  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 241 aa  124  9e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  40.19 
 
 		 242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 265 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  38.77 
 
 		 248 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 247 aa  112  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 253 aa  111  8.000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  35.04 
 
 		 264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  37.99 
 
 		 259 aa  108  6e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  39.23 
 
 		 293 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  37.09 
 
 		 315 aa  107  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  36.53 
 
 		 255 aa  107  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  32.59 
 
 		 248 aa  106  3e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 283 aa  105  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  52.27 
 
 		 230 aa  105  8e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 315 aa  103  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  35.62 
 
 		 342 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  38.43 
 
 		 250 aa  100  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  34.36 
 
 		 249 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 239 aa  95.9  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 311 aa  95.9  5e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  31.12 
 
 		 268 aa  94.7  1e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  38.14 
 
 		 272 aa  94.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 223 aa  93.6  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 249 aa  93.6  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3346  regulatory protein, TetR  34.36 
 
 		 262 aa  93.6  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.213794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 269 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2560  TetR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 272 aa  90.5  2e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.283011  normal  0.208167 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 253 aa  90.5  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.71 
 
 		 224 aa  89.7  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 235 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 228 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 255 aa  89.4  5e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  37.42 
 
 		 221 aa  89  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  36.68 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  35.78 
 
 		 250 aa  87.8  1e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 222 aa  87.8  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  33.05 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 267 aa  87.4  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 245 aa  86.7  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  41.22 
 
 		 218 aa  85.9  5e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 250 aa  85.9  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 		 263 aa  85.5  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  35.02 
 
 		 214 aa  84  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  33.18 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  29.96 
 
 		 271 aa  83.2  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3140  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.852276  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3202  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.437074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3152  TetR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 250 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  41.73 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2430  transcriptional regulator, TetR family  30.7 
 
 		 252 aa  82.4  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.522174  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  40.52 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 221 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 242 aa  81.6  0.000000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 233 aa  81.6  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  31.78 
 
 		 248 aa  81.3  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  38.26 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  33.48 
 
 		 223 aa  80.1  0.00000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00320  transcriptional regulator, tetR family  33.47 
 
 		 256 aa  78.2  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.48619  normal  0.068604 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 231 aa  77  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 253 aa  76.6  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  36.52 
 
 		 239 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  32.57 
 
 		 247 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  29.39 
 
 		 304 aa  75.5  0.0000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4456  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 258 aa  75.5  0.0000000000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.162192 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1468  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 283 aa  75.5  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  32.02 
 
 		 257 aa  74.3  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 246 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1632  transcriptional regulator, TetR family  28.84 
 
 		 310 aa  73.6  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275496  normal  0.111085 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 263 aa  72.4  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1694  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 252 aa  72.4  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.239761 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 281 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19920  transcriptional regulator, tetR family  37.5 
 
 		 207 aa  72  0.000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.314765  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  35.83 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 220 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30920  transcriptional regulator, tetR family  29.11 
 
 		 266 aa  71.2  0.00000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0092  GntR family transcriptional regulator  34.11 
 
 		 330 aa  70.9  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  40.15 
 
 		 211 aa  70.5  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  28.12 
 
 		 260 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 237 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 266 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 240 aa  69.7  0.00000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 223 aa  68.9  0.00000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  34.84 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4362  regulatory protein, TetR  31.71 
 
 		 256 aa  68.2  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  33.04 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6279  transcriptional regulator, TetR family  41.13 
 
 		 235 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 183 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  28.77 
 
 		 210 aa  66.6  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 232 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>