More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2797 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  484  1e-136  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  48.47 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 245 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 271 aa  158  6e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 		 246 aa  132  3e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  32.55 
 
 		 233 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  35.1 
 
 		 241 aa  106  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 		 225 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  33.97 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 218 aa  95.5  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 249 aa  95.1  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  30.94 
 
 		 222 aa  94  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 234 aa  92  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 250 aa  90.9  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  33.04 
 
 		 255 aa  90.1  3e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 224 aa  89.4  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 223 aa  89  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  33.95 
 
 		 249 aa  85.1  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 207 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  28.15 
 
 		 268 aa  84.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  32.87 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 214 aa  82.8  0.000000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 285 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  30.96 
 
 		 315 aa  80.5  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 263 aa  80.9  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  27.93 
 
 		 239 aa  79  0.00000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 218 aa  79  0.00000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 304 aa  77.8  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  32.53 
 
 		 210 aa  77.4  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 226 aa  77  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  29.82 
 
 		 342 aa  76.6  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 218 aa  76.3  0.0000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  28.63 
 
 		 247 aa  76.3  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 		 212 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 223 aa  75.1  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3270  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 225 aa  73.9  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.8331  normal  0.0947304 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 221 aa  74.3  0.000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  30.96 
 
 		 241 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 272 aa  73.2  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  29.65 
 
 		 222 aa  73.2  0.000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  27.01 
 
 		 227 aa  73.2  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 226 aa  72  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 315 aa  72  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.09 
 
 		 343 aa  71.6  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 240 aa  70.5  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  33.79 
 
 		 183 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 239 aa  70.1  0.00000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  35.95 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  34.01 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  31.58 
 
 		 311 aa  69.3  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  28.25 
 
 		 250 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  29.36 
 
 		 231 aa  69.3  0.00000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 267 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  68.9  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  31.18 
 
 		 226 aa  68.9  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  27.51 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 258 aa  68.6  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  28.23 
 
 		 278 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3530  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 267 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0209016  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  34.58 
 
 		 250 aa  67.4  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  29.18 
 
 		 259 aa  67.4  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4446  hypothetical protein  26.81 
 
 		 229 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.25718 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 263 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 233 aa  67.4  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 247 aa  67.8  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  35.62 
 
 		 203 aa  67  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 236 aa  66.6  0.0000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 200 aa  66.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  33.57 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  29.77 
 
 		 244 aa  66.6  0.0000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  33.55 
 
 		 239 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  23.28 
 
 		 260 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4960  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0493125  normal  0.261942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  27.19 
 
 		 220 aa  65.5  0.0000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 		 234 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  36.77 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 281 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>