213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0414 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0414  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
233 aa  468  1.0000000000000001e-131  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  56.73 
 
 
241 aa  226  3e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  34.02 
 
 
271 aa  145  6e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  33.47 
 
 
246 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  35.43 
 
 
253 aa  141  9e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  34.08 
 
 
245 aa  135  7.000000000000001e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.71 
 
 
242 aa  126  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 
229 aa  91.7  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 
234 aa  87.4  2e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 
224 aa  80.1  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
315 aa  77  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  26.41 
 
 
268 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6425  putative transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
247 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00857124 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 
225 aa  72.4  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  27.02 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  27.83 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 
230 aa  70.1  0.00000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  30.34 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  25.69 
 
 
223 aa  68.9  0.00000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1498  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 
278 aa  67  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 
224 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1498  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.98693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1521  TetR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
244 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.290905  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 
223 aa  65.5  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  25.46 
 
 
235 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 
285 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  24.77 
 
 
223 aa  64.3  0.000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  23.01 
 
 
236 aa  64.3  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  23.85 
 
 
239 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 
230 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  27.78 
 
 
343 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 
250 aa  63.2  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 
207 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 
218 aa  62.8  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  23.77 
 
 
255 aa  62.4  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 
237 aa  62  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  29.22 
 
 
241 aa  62  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  27.47 
 
 
218 aa  62  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3395  transcriptional regulator, TetR family  35.79 
 
 
173 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.542573  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 
224 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  28 
 
 
268 aa  61.6  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 
231 aa  61.6  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  24.67 
 
 
221 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 
247 aa  60.5  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
240 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 
234 aa  60.1  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2211  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 
211 aa  60.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 
228 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2177  TetR family transcriptional regulator  25.34 
 
 
193 aa  59.7  0.00000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.191251  normal  0.46056 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  27.33 
 
 
232 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  29.58 
 
 
213 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  23.74 
 
 
260 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 
228 aa  58.9  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 
234 aa  58.5  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  27.66 
 
 
218 aa  58.5  0.00000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 
250 aa  58.5  0.00000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0039  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 
272 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 
221 aa  58.2  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  28.38 
 
 
233 aa  58.2  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3884  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 
304 aa  57.4  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.162563 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  24.9 
 
 
268 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  27.21 
 
 
183 aa  56.2  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  21.62 
 
 
238 aa  56.2  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4056  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 
209 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.910923  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  30 
 
 
342 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 
255 aa  55.1  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4689  transcriptional regulator, TetR family  24.78 
 
 
259 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  29.45 
 
 
227 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  25.94 
 
 
212 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 
263 aa  55.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  27.13 
 
 
222 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1669  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  25.46 
 
 
223 aa  54.3  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  24.11 
 
 
258 aa  54.3  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3445  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 
230 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  22.92 
 
 
211 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 
202 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  23.96 
 
 
226 aa  53.1  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  28.1 
 
 
190 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  26.58 
 
 
220 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  24.89 
 
 
226 aa  52.8  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 
259 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
283 aa  52.4  0.000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  25.85 
 
 
219 aa  52  0.000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  25.75 
 
 
211 aa  52  0.000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  25.25 
 
 
220 aa  52  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0039  transcriptional regulator  26.88 
 
 
233 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26640  transcriptional regulator, tetR family  28 
 
 
215 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.062936  normal  0.0737104 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4047  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 
231 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  27.66 
 
 
257 aa  51.2  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 
253 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  23.6 
 
 
265 aa  51.6  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>