More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8044 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 249 aa  493  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  54.04 
 
 		 272 aa  232  4.0000000000000004e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  46.58 
 
 		 268 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  42.27 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  40.71 
 
 		 228 aa  153  2.9999999999999998e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  40.43 
 
 		 226 aa  134  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  34.57 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 234 aa  125  9e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 240 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  32.17 
 
 		 233 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  31.49 
 
 		 272 aa  110  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  110  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 224 aa  108  6e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  33.18 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  33.19 
 
 		 231 aa  106  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 230 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 271 aa  102  4e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 257 aa  102  6e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 228 aa  100  2e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 221 aa  100  3e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  31.82 
 
 		 343 aa  99  7e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 263 aa  97.8  1e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1370  transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 223 aa  97.4  2e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.705116 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  32.66 
 
 		 255 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4066  putative transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 		 253 aa  95.5  7e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.546263  normal  0.272387 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  31.74 
 
 		 236 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2060  transcriptional regulator, TetR family  31.69 
 
 		 266 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.582496  normal  0.158127 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8685  Tetracyclin repressor domain protein  34.78 
 
 		 228 aa  93.2  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  31.09 
 
 		 260 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 242 aa  92  8e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4687  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 259 aa  91.7  1e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  29 
 
 		 222 aa  90.9  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2052  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 241 aa  90.1  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.654374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  31.6 
 
 		 229 aa  90.1  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4137  putative transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0181128  normal  0.0240758 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 242 aa  89.7  4e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 214 aa  89  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 267 aa  89  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 246 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0897  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 265 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7217  putative transcriptional regulator, TetR family  30.13 
 
 		 247 aa  85.9  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.466124  normal  0.580256 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0056  transcriptional regulator, TetR family  31.28 
 
 		 289 aa  85.9  5e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5933  regulatory protein TetR  33.87 
 
 		 250 aa  86.3  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.164219 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 278 aa  85.9  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9231  tetR-family regulatory protein  31.38 
 
 		 247 aa  85.5  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.484933  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0801  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 226 aa  85.1  9e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1050  TetR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 238 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.361662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  32.27 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.4 
 
 		 253 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 248 aa  82.8  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 213 aa  82  0.000000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0664  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 235 aa  82  0.000000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.773977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  29.36 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  31.42 
 
 		 261 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  30.82 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2497  putative transcriptional regulator, GntR family  31.94 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.182047 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 315 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2698  Tetracyclin repressor domain protein  30.95 
 
 		 239 aa  80.1  0.00000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5652  transcriptional regulator, TetR family  28.34 
 
 		 283 aa  80.1  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1460  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  29.71 
 
 		 268 aa  79.7  0.00000000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0638  TetR family transcriptional regulator  31.67 
 
 		 250 aa  79.3  0.00000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0660253 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  30.04 
 
 		 264 aa  79  0.00000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 255 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2480  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 221 aa  78.6  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0883171  normal  0.233137 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 225 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5556  transcriptional regulator, GntR family  29.36 
 
 		 311 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  35.63 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 250 aa  75.5  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7747  putative transcriptional regulator  30.45 
 
 		 342 aa  75.1  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 		 212 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3007  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 239 aa  75.1  0.000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0040024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 210 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0744  TetR family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 224 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0222814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5425  putative transcriptional regulator, TetR family  31.88 
 
 		 272 aa  73.9  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  33.76 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4078  TetR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 269 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.152777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 218 aa  73.6  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  27.23 
 
 		 223 aa  73.6  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2404  transcriptional regulator, TetR family  29.6 
 
 		 247 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0783886 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0251  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 202 aa  72.8  0.000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3268  putative transcriptional regulator, GntR family  28.76 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  31.07 
 
 		 222 aa  72.4  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0240  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 281 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.679484 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  29.81 
 
 		 210 aa  72.4  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.96 
 
 		 211 aa  72.4  0.000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  28.95 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  32.88 
 
 		 213 aa  71.6  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0672  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 257 aa  71.6  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.607833  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>