More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_19280 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_19280  transcriptional regulator  100 
 
 
235 aa  463  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.28299  normal  0.286722 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6339  transcriptional regulator, TetR family  45.74 
 
 
225 aa  169  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5353  putative transcriptional regulator, TetR family  47.6 
 
 
226 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.565749  normal  0.831003 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0632  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
226 aa  99.8  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.639401  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  32.7 
 
 
217 aa  89.4  4e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3560  TetR family transcriptional regulator  32.68 
 
 
247 aa  78.6  0.00000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.499755  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4679  regulatory protein TetR  28.64 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 
195 aa  72  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
229 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 
249 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  33.08 
 
 
268 aa  64.3  0.000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 
268 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  24.57 
 
 
260 aa  62.4  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0460  regulatory protein TetR  32.02 
 
 
227 aa  62  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.266812  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 
234 aa  61.6  0.00000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1952  regulatory protein TetR  41.67 
 
 
241 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 
249 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 
242 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1040  regulatory protein TetR  34.1 
 
 
219 aa  60.5  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.591621  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  34.87 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  23.04 
 
 
236 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0252  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 
221 aa  58.5  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0730  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 
242 aa  57  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00296779  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5957  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 
229 aa  57.4  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.769485  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1704  transcriptional regulator, TetR family  38.61 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.417933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 
245 aa  56.6  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 
224 aa  56.2  0.0000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4047  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 
231 aa  55.8  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1315  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
255 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.156581 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7832  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 
253 aa  55.5  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0353896 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1965  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 
234 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.66981  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 
272 aa  55.1  0.0000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0279  transcriptional regulator, TetR family  27.15 
 
 
268 aa  55.1  0.0000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4638  putative transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 
196 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.856697 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  29.41 
 
 
343 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6537  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 
230 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.563628  normal  0.0265458 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  26.91 
 
 
234 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 
223 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6521  putative transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 
210 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.177383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  45.9 
 
 
218 aa  53.5  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 
231 aa  53.5  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
241 aa  52.8  0.000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 
228 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
270 aa  53.1  0.000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  40.35 
 
 
185 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0040  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 
211 aa  52.8  0.000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.970085  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  37.07 
 
 
240 aa  52.8  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  26.55 
 
 
221 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  40.35 
 
 
185 aa  52.8  0.000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 
215 aa  52.4  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  28.31 
 
 
239 aa  52.4  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  25.43 
 
 
233 aa  52.4  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 
222 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  37.5 
 
 
193 aa  52  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  35.25 
 
 
230 aa  52  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  22.84 
 
 
190 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3462  regulatory protein TetR  35.71 
 
 
221 aa  51.2  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0249959  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  32.26 
 
 
232 aa  51.6  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4046  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 
212 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0961065 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1898  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00182667  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 
226 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3400  transcriptional regulator, TetR family  37 
 
 
248 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.160802  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3568  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5716  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 
255 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.831325 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  28.12 
 
 
227 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
225 aa  50.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
285 aa  50.8  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10695  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
203 aa  50.1  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2448  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 
202 aa  50.4  0.00003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2493  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
192 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.126348  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2485  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 
192 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
203 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2727  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 
264 aa  49.7  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5853  transcriptional regulator, TetR family  45 
 
 
258 aa  49.7  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.389129  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0437  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 
239 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 
238 aa  49.7  0.00004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  32.29 
 
 
223 aa  49.7  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5079  TetR family transcriptional regulator  34.44 
 
 
192 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.925622 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  26.84 
 
 
198 aa  49.3  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 
234 aa  48.9  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3083  regulatory protein TetR  31.68 
 
 
248 aa  48.9  0.00007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.143154  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  45.83 
 
 
214 aa  48.9  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0628  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 
218 aa  48.9  0.00007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.504351 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 
263 aa  48.5  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
213 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0983  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
188 aa  48.5  0.00008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1001  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.735096  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1011  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
212 aa  48.5  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.632644 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 
220 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1949  hypothetical protein  26.53 
 
 
186 aa  48.5  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>