280 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1662 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  409  1e-113  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  43.96 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  38.94 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  36.27 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  36.27 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  36.27 
 
 		 225 aa  108  8.000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  38.32 
 
 		 220 aa  107  9.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  46.41 
 
 		 212 aa  106  2e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  38.68 
 
 		 206 aa  98.6  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  38.21 
 
 		 210 aa  97.1  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 210 aa  96.3  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 210 aa  95.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  35.41 
 
 		 192 aa  95.1  8e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  43.54 
 
 		 211 aa  94.7  9e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5105  transcriptional regulator, TetR family  33.94 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000423081  normal  0.55194 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 190 aa  92  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  39.29 
 
 		 203 aa  90.1  2e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  37.41 
 
 		 200 aa  87  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 238 aa  82.4  0.000000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 192 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  37.32 
 
 		 223 aa  80.9  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 190 aa  79.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8044  putative transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 249 aa  75.9  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  36.49 
 
 		 199 aa  74.3  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  34.93 
 
 		 268 aa  71.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1119  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.335801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 185 aa  68.6  0.00000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2646  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00299352  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 239 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.314261  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5582  transcriptional regulator, TetR family  30.33 
 
 		 250 aa  67  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1997  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.354177  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  34.53 
 
 		 271 aa  66.6  0.0000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4140  transcriptional regulator, TetR family  34 
 
 		 240 aa  65.5  0.0000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 211 aa  64.7  0.0000000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  29.79 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 285 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0683  transcriptional regulator, TetR family  30.35 
 
 		 233 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.124954 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  34.93 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7234  putative transcriptional regulator, TetR family  31.92 
 
 		 249 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.163759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1690  transcriptional regulator, TetR family  31.72 
 
 		 222 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.072365  hitchhiker  0.0000000604778 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 234 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0819  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4938  regulatory protein, TetR  30.71 
 
 		 222 aa  62.4  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0214473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3954  transcriptional regulator, TetR family  34.23 
 
 		 183 aa  62.4  0.000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00776564  normal  0.0886939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4845  putative transcriptional regulator, TetR family  35.34 
 
 		 230 aa  61.6  0.000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2378  transcriptional repressor TetR  25.84 
 
 		 260 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0287531  normal  0.0684522 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6218  TetR family transcriptional regulator  28.44 
 
 		 278 aa  60.8  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4294  transcriptional regulator, GntR family  42.22 
 
 		 343 aa  60.8  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.806766 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8893  transcriptional regulator, TetR family  29.93 
 
 		 272 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5576  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6498  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1989  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1711  regulatory protein TetR  31.51 
 
 		 226 aa  59.7  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.539832  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2357  transcriptional regulator, TetR family  30.24 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3174  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 230 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0201096  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 229 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2273  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3718  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 223 aa  58.2  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000868131  normal  0.31083 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4781  transcriptional regulator, TetR family  28.76 
 
 		 228 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.809331  hitchhiker  0.00725959 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4355  TetR family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 244 aa  57  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589486  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4284  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 		 223 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4050  transcriptional regulator, TetR family  29.86 
 
 		 221 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0170602 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3300  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.513465  hitchhiker  0.00580905 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  40.43 
 
 		 216 aa  55.8  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6464  putative transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 245 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0682753 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6418  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 		 259 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1770  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1817  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1751  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 250 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8156  putative transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 272 aa  54.7  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11383  transcriptional regulator  25.44 
 
 		 261 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.900966 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2420  regulatory protein TetR  38.89 
 
 		 190 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000385349  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0017  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1037  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.97893  normal  0.250899 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2337  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1167  regulatory protein, TetR  29.38 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2596  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 257 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.476942 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0522  transcriptional regulator, TetR family  31.64 
 
 		 259 aa  54.7  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0445084 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3980  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 268 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  30.6 
 
 		 220 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0716  transcriptional regulator, TetR family  37.36 
 
 		 231 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0221174  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4181  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 240 aa  52.4  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.367396  normal  0.615524 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4458  transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 263 aa  52.8  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0794126 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  26.52 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  23.58 
 
 		 218 aa  52.4  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 239 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  24.04 
 
 		 210 aa  51.6  0.000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3639  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 234 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4098  TetR family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 315 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 208 aa  51.6  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 238 aa  51.2  0.00001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>