More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_3070 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_3070  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 216 aa  423  1e-117  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 192 aa  117  9e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4132  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.88155  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3348  TetR family transcriptional regulator  44.31 
 
 		 185 aa  112  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21360  transcriptional regulator, TetR family  41.21 
 
 		 206 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.127836  normal  0.357603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 190 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2976  regulatory protein TetR  38.62 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  46.45 
 
 		 190 aa  103  3e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  81.6  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 210 aa  81.3  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  36.04 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  36.04 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  36.04 
 
 		 225 aa  78.6  0.00000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1662  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 213 aa  77.4  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.552653  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7060  tetracycline repressor domain-containing protein  36.73 
 
 		 203 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0598818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1930  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.189169  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0658  TetR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 211 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1677  transcriptional regulator, TetR family  37.01 
 
 		 218 aa  75.9  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00000521041  normal  0.168881 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2637  putative transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 220 aa  75.5  0.0000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.000568428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 211 aa  75.1  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19490  transcriptional regulator, tetR family  50 
 
 		 168 aa  69.7  0.00000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2728  putative transcriptional regulator, TetR family  35.57 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.427892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2797  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 242 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.139894  normal  0.287212 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3273  Tetracyclin repressor domain protein  32.77 
 
 		 213 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.120229  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1254  TetR family transcriptional regulator  44.19 
 
 		 223 aa  62.4  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.297921  normal  0.284076 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4216  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00833872  hitchhiker  0.000365538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0036  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 234 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.940738 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0215  transcriptional regulator, TetR family  29.11 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.674801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2840  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2997  transcriptional regulator, TetR family  49.25 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00034517  decreased coverage  0.000048455 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0408  transcriptional regulator, TetR family  43.82 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.431467 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0693  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 207 aa  56.6  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.000000831417  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0419  transcriptional reguator, TetR family  29.25 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8986  putative transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 220 aa  56.2  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1945  putative transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 268 aa  55.5  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.951149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0391  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.799275  normal  0.207381 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2916  TetR family transcriptional regulator  31.29 
 
 		 216 aa  55.5  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3892  transcriptional regulator, TetR family  35.42 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4757  regulatory protein, TetR  31.13 
 
 		 220 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0842681 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4128  TetR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 241 aa  55.1  0.0000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.860792 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1551  TetR family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 225 aa  55.1  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209171  normal  0.107881 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0938  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 235 aa  54.3  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1048  transcriptional regulator, TetR family  35.96 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0498897  normal  0.620598 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  50.98 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 210 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1243  TetR family transcriptional regulator  39.8 
 
 		 229 aa  53.5  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.176443 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3543  TetR family transcriptional regulator  43.04 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0364286 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10210  transcriptional regulator  42.65 
 
 		 272 aa  53.9  0.000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.472309  normal  0.0650558 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  40.32 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5146  transcriptional regulator PhaD  34.41 
 
 		 204 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 214 aa  53.1  0.000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2585  transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 218 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.106012  normal  0.0213025 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5638  TetR family transcriptional regulator  21.97 
 
 		 238 aa  52.8  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.491763  normal  0.336395 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1828  regulatory protein TetR  32.32 
 
 		 207 aa  52.8  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.790266  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3544  transcriptional regulator, TetR family  32.41 
 
 		 258 aa  52.8  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.164716  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1404  hypothetical protein  45.45 
 
 		 227 aa  52.4  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.245587  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0104  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 207 aa  52.4  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000192911 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3927  transcriptional regulator, TetR family  33.81 
 
 		 218 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.69466  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0683  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0129651  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0901  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5798  putative transcriptional regulator  38.46 
 
 		 205 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4572  putative transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 223 aa  52  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.145324  normal  0.111989 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0462  putative transcriptional regulator  40.74 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66850  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2285  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0214  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 218 aa  51.6  0.000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.705047  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04820  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 215 aa  51.6  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  41.79 
 
 		 258 aa  51.6  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2159  TetR family transcriptional regulator  26.72 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0527  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 204 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0603321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0458  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 204 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4993  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5119  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1914  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0346  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 221 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 211 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2237  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 236 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.252605 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1017  TetR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.056125 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5056  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 204 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4604  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 255 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1499  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 271 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.148288  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 235 aa  50.1  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0205  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 208 aa  49.7  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.555741  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0102  TetR family transcriptional regulator  36.54 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.478027 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5006  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.162058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0944  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.62 
 
 		 217 aa  49.7  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4880  TetR family transcriptional regulator  33.85 
 
 		 204 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0349  transcriptional regulator, TetR family  25.33 
 
 		 237 aa  50.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0537  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.62 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.355505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0518  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.62 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.35266  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2574  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 203 aa  49.3  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0758263 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0580  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  39.62 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0809226  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>