More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0354 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 214 aa  417  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  46.7 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  40.08 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  40.54 
 
 		 333 aa  137  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 207 aa  100  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 202 aa  95.5  5e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  32.45 
 
 		 224 aa  92.4  4e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 204 aa  91.7  8e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 206 aa  87.4  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  30.88 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  82.4  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  33.67 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 214 aa  80.1  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 203 aa  79.3  0.00000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 231 aa  79  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 200 aa  78.2  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  36.81 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 216 aa  78.2  0.0000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 197 aa  77.4  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35 
 
 		 196 aa  77  0.0000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 257 aa  76.3  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 210 aa  76.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 234 aa  76.3  0.0000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  31.84 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  38.39 
 
 		 223 aa  76.3  0.0000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  37.13 
 
 		 230 aa  75.1  0.0000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 200 aa  75.1  0.0000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  39.62 
 
 		 199 aa  75.1  0.0000000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 203 aa  73.9  0.000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 232 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 212 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  39.75 
 
 		 196 aa  72.8  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.63 
 
 		 203 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 203 aa  71.6  0.000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 195 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 199 aa  71.2  0.00000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 212 aa  71.2  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  31.47 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 217 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  34.34 
 
 		 207 aa  68.9  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 222 aa  67.4  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  33.16 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 		 206 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  36.19 
 
 		 209 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  28.17 
 
 		 243 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  32.16 
 
 		 228 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  31.93 
 
 		 184 aa  65.5  0.0000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 212 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  34.46 
 
 		 196 aa  64.7  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  29.89 
 
 		 203 aa  64.7  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  35.98 
 
 		 192 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 211 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  31.72 
 
 		 221 aa  63.2  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 236 aa  63.2  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 190 aa  62.8  0.000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  32.16 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  62  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 231 aa  62.4  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  33.91 
 
 		 216 aa  61.6  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  26.59 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  34.38 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 211 aa  60.5  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.02 
 
 		 212 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1597  putative transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 174 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  32.75 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  20.77 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 221 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  36.2 
 
 		 186 aa  59.7  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 236 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  26.39 
 
 		 220 aa  58.5  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  31.1 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 240 aa  58.5  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2169  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 205 aa  58.5  0.00000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0813077  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>