More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_1710 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  406  1e-113  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  26.09 
 
 		 198 aa  67.8  0.0000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 213 aa  65.1  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  25.31 
 
 		 202 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  26.18 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  25.73 
 
 		 207 aa  62.4  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1053  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 193 aa  61.2  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 198 aa  61.2  0.000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 195 aa  60.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 200 aa  60.5  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  20.83 
 
 		 196 aa  59.7  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 204 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3709  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1283  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000248972  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  24.84 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  20.79 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 195 aa  58.5  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 770 aa  58.5  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1128  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.09 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000181094 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3410  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000655293  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  20.12 
 
 		 213 aa  58.2  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  21.35 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  18.56 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1903  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000201758  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 213 aa  57  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001824  transcriptional regulator  25.15 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000410739  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2425  TetR family transcriptional regulator  29.87 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.520855  normal  0.599881 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0355  transcriptional regulator, TetR family  27.53 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8489  putative transcriptional regulator, TetR family  22.53 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.280909  normal  0.379927 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 212 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2948  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  25.9 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  21.65 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00651  nucleoid occlusion protein  24.56 
 
 		 196 aa  54.7  0.0000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3948  transcriptional regulator, TetR family  25.83 
 
 		 180 aa  54.7  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3502  nucleoid occlusion protein  22.02 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.284468  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 194 aa  54.7  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  21.08 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0951  TetR family transcriptional regulator  22.89 
 
 		 196 aa  54.3  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2974  transcriptional regulator, TetR family  22.81 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3074  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3134  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.641409  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2792  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.782155  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3091  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0742554 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3625  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.130567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3170  transcriptional regulator, TetR family  31.51 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  21.85 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2320  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 195 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05720  transcriptional regulator  22.45 
 
 		 221 aa  53.1  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.203838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  20.99 
 
 		 349 aa  53.5  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3240  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  26.23 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.501766  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3559  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.94 
 
 		 220 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00735263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0224  transcriptional regulator, TetR-family  25.43 
 
 		 192 aa  53.1  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4611  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 371 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.73 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3535  transcriptional regulator, TetR family  24.28 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10053  putative TetR transcriptional regulator  33.77 
 
 		 194 aa  52.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.205087  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23630  transcriptional regulator  38.81 
 
 		 210 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.119387 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2781  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000487748 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1393  TetR family transcriptional regulator  24.34 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.733503 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0620  nucleoid occlusion protein  20.51 
 
 		 197 aa  53.1  0.000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000140669 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1833  TetR family transcriptional regulator  19.41 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.150168  normal  0.286062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0913  TetR family transcriptional regulator  22.6 
 
 		 195 aa  52.8  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.269174  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4056  TetR family transcriptional regulator  22.8 
 
 		 193 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3704  TetR family transcriptional regulator  19.77 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  20 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  20.51 
 
 		 233 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  23.86 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6164  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 285 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.406893 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  22.36 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3835  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3852  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1920  TetR family transcriptional regulator  21.6 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3046  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  24.23 
 
 		 216 aa  51.6  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.303422  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3469  transcriptional regulator, TetR family  21.02 
 
 		 219 aa  51.6  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.930137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0665  TetR family transcriptional regulator  20.71 
 
 		 195 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13181  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 213 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000106336  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4123  hypothetical protein  28.38 
 
 		 189 aa  51.6  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.39248 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  22.45 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4608  TetR family transcriptional regulator  22.47 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.198377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  20.59 
 
 		 199 aa  51.2  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  21.47 
 
 		 192 aa  51.2  0.000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  20.32 
 
 		 219 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  21.85 
 
 		 224 aa  51.2  0.000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0442  transcriptional regulator, TetR family  22.48 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.671353  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2593  nucleoid occlusion protein  23.56 
 
 		 210 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000323733  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2496  transcriptional regulator, TetR family  23.26 
 
 		 226 aa  50.4  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.40575  normal  0.202338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  22.36 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1674  TetR family transcriptional regulator  21.43 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.997457 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3749  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.48 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000431628  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  25.86 
 
 		 252 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3457  DNA-binding transcriptional regulator EnvR  22.48 
 
 		 220 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000315342  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  22.01 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>