More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1896 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 204 aa  410  1e-114  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  58.01 
 
 		 233 aa  208  4e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  44.02 
 
 		 199 aa  157  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  40.98 
 
 		 269 aa  134  6.0000000000000005e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  35.53 
 
 		 298 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 207 aa  120  1.9999999999999998e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  38.12 
 
 		 200 aa  118  4.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 221 aa  118  7e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 194 aa  116  1.9999999999999998e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 207 aa  115  6e-25  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  34.9 
 
 		 203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  35.18 
 
 		 203 aa  105  6e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  32.81 
 
 		 209 aa  102  3e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 214 aa  96.3  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  31.77 
 
 		 201 aa  90.1  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 202 aa  85.1  6e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 221 aa  70.5  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  30.86 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 187 aa  62.8  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 193 aa  61.6  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  22.67 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  24.44 
 
 		 193 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  27.23 
 
 		 287 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3860  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 236 aa  57.8  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.195527  normal  0.716599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22250  transcriptional regulator  27.63 
 
 		 196 aa  55.5  0.0000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0446991  normal  0.543201 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3867  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 225 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.53155  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3882  transcriptional regulator, TetR family  31.39 
 
 		 190 aa  55.5  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 189 aa  55.1  0.0000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1858  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 234 aa  54.3  0.000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.543066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  32.33 
 
 		 228 aa  54.3  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 210 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 213 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  23.56 
 
 		 216 aa  52.8  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  25.57 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4372  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  52.4  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0837582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4901  TetR family transcriptional regulator  27.07 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  22.96 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.403978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0811  transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1699  transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 205 aa  51.2  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.502572  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4429  TetR family transcriptional regulator  28.31 
 
 		 197 aa  51.2  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.679698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  26.51 
 
 		 190 aa  51.2  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0856  TetR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.257581  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  23 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  25.32 
 
 		 202 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0897  TetR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0955  TetR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1320  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 199 aa  50.1  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2926  TetR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.529467  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4804  transcriptional regulator, TetR family  25.41 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.120851  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2880  TetR family transcriptional regulator  26.2 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.226546 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3194  transcriptional regulator, TetR family  21.52 
 
 		 188 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4824  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2863  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000603343 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 245 aa  49.7  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0744  regulatory protein TetR  28.69 
 
 		 191 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  31.15 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  27.22 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0839  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0805  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  23.76 
 
 		 199 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1344  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 205 aa  49.3  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592645 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.3 
 
 		 195 aa  49.3  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  24.58 
 
 		 207 aa  49.3  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  27.69 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2044  transcriptional regulator, TetR family  21.52 
 
 		 188 aa  49.3  0.00004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.505226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2970  TetR family transcriptional regulator  21.52 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0560  transcriptional regulator, TetR family  24.14 
 
 		 208 aa  48.9  0.00005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3236  transcriptional regulator, TetR family  21.52 
 
 		 194 aa  48.9  0.00005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0469246  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2174  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 202 aa  48.9  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  23.46 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1934  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 202 aa  48.5  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0322407  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0215  TetR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3212  transcriptional regulator, TetR family  21.52 
 
 		 188 aa  48.5  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1864  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0665556  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 194 aa  48.5  0.00007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2209  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 204 aa  48.5  0.00007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  24.7 
 
 		 201 aa  48.1  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0979  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 196 aa  48.1  0.00009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 195 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2781  regulatory protein TetR  28.4 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.83276  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07011  transcriptional regulator  26.47 
 
 		 189 aa  47.8  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3173  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 245 aa  47.4  0.0001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>