166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmag_0786 on replicon NC_013922
Organism: Natrialba magadii ATCC 43099



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 202 aa  409  1e-113  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  45.18 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  42.6 
 
 		 203 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 214 aa  128  7.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  39.81 
 
 		 228 aa  120  9.999999999999999e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  42.77 
 
 		 201 aa  116  3e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  38.51 
 
 		 225 aa  107  1e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 221 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  36.65 
 
 		 200 aa  107  1e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  34.71 
 
 		 209 aa  103  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  34.66 
 
 		 269 aa  102  4e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 199 aa  101  7e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 194 aa  101  8e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 233 aa  101  8e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 207 aa  100  1e-20  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  97.1  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 204 aa  86.3  3e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 213 aa  55.8  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  27.14 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  22.51 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  23.94 
 
 		 200 aa  50.8  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4071  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365856  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  25.79 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 236 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4218  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.135159  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  25.17 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10159  TetR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4362  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 228 aa  48.9  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0699129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  25.82 
 
 		 242 aa  48.5  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  27.21 
 
 		 239 aa  48.5  0.00007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4427  TetR family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 213 aa  48.1  0.00009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11588  regulatory protein  21.98 
 
 		 202 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  7.8751e-36  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2708  transcriptional regulator BetI  30 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0450  transcriptional regulator, TetR family  24.36 
 
 		 349 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0035112 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0899  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.494549  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6683  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  23.08 
 
 		 212 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4115  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.1417 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5093  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0355233 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1805  hypothetical protein  24.19 
 
 		 202 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  23.88 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 226 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47520  putative transcriptional regulator  30.3 
 
 		 197 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  45.8  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1613  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 189 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.066311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6913  putative transcriptional regulator, TetR family  39.13 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10080  Transcriptional regulator, TetR family  27.5 
 
 		 217 aa  45.4  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.530554  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1467  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 217 aa  45.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0554  transcriptional regulator BetI  28.75 
 
 		 198 aa  45.4  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2070  transcriptional regulator BetI  24.68 
 
 		 202 aa  45.4  0.0006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0555  transcriptional regulator BetI  28.75 
 
 		 201 aa  45.4  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0570  TetR family transcriptional regulator  23.6 
 
 		 209 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0552  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  30.23 
 
 		 208 aa  45.4  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3408  TetR family transcriptional regulator  28.81 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.954504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 198 aa  45.1  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0719  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 212 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4280  transcriptional regulator, TetR family  22.84 
 
 		 203 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.409841  normal  0.686522 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0126  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 		 224 aa  44.7  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  23.53 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0135  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 217 aa  44.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0144  TetR family transcriptional regulator  44.9 
 
 		 181 aa  44.3  0.001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1323  transcriptional regulator BetI  25.45 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3710  regulatory protein, TetR  32.81 
 
 		 230 aa  44.3  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1313  transcriptional regulator BetI  25.45 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  22.64 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3037  transcriptional regulator BetI  25.45 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.116716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1088  transcriptional regulator, TetR family  20.86 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1986  TetR family transcriptional regulator  19.89 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0191052  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0982  TetR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7205  transcriptional regulator, TetR family  27.63 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.61042  normal  0.776649 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0971  TetR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0546  regulatory protein TetR  23.94 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1052  TetR family transcriptional regulator  21.13 
 
 		 193 aa  43.1  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0519  TetR family transcriptional regulator  30.23 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4351  transcriptional regulator, TetR family  21.19 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.710621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26800  transcriptional regulator  33.33 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.463482  normal  0.288316 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  22.28 
 
 		 202 aa  43.5  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3831  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.484216  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 199 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1349  transcriptional regulator BetI  25.45 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.287074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0556  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  26.72 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2165  transcriptional regulator, TetR family  23.65 
 
 		 263 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22560  transcriptional regulator, tetR family  25.54 
 
 		 208 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0880115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1550  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 209 aa  43.5  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3825  regulatory protein TetR  33.9 
 
 		 203 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.141016  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>