283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0893 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 201 aa  405  1.0000000000000001e-112  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  47.67 
 
 		 207 aa  153  2e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1316  transcriptional regulator, TetR family  41.05 
 
 		 298 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1374  transcriptional regulator, TetR family  44.56 
 
 		 225 aa  138  4.999999999999999e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.181966  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  42.13 
 
 		 269 aa  135  3.0000000000000003e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1896  transcriptional regulator, TetR family  38.95 
 
 		 204 aa  135  3.0000000000000003e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1935  transcriptional regulator, TetR family  43.83 
 
 		 233 aa  127  7.000000000000001e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  41.8 
 
 		 221 aa  126  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1807  transcriptional regulator, TetR family  38.22 
 
 		 199 aa  125  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 200 aa  121  6e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4340  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 203 aa  121  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2919  transcriptional regulator, TetR family  39.06 
 
 		 203 aa  115  3.9999999999999997e-25  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0416345  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1806  transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 		 207 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.382485 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3888  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 214 aa  108  4.0000000000000004e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0499  transcriptional regulator, TetR family  37.17 
 
 		 201 aa  106  2e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.38098  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0786  transcriptional regulator, TetR family  40.43 
 
 		 202 aa  105  3e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.536081  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0748  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.866187  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2800  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 206 aa  88.6  5e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1196  transcriptional regulator, TetR family  36.72 
 
 		 228 aa  72.4  0.000000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.000000002147  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1710  transcriptional regulator, TetR family  22.68 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0070  transcriptional regulator, TetR family  30.92 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0773  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0502  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1638  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1991  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  24.62 
 
 		 202 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0573  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0810713  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0938  transcriptional regulator, TetR family  25.48 
 
 		 231 aa  52.8  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0638862 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0685  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2087  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 232 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.390005  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0873  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 231 aa  52.4  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.326269 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 195 aa  52.4  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0891  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0626  TetR family transcriptional regulator  24.1 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  24.83 
 
 		 194 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16270  transcriptional regulator  26.38 
 
 		 287 aa  51.2  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3921  TetR family transcriptional regulator  30.13 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2099  transcriptional regulator, TetR family  28.04 
 
 		 216 aa  50.1  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0886  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2399  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 204 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0482124  hitchhiker  0.0000585185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0170  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 192 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.652591  normal  0.659974 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5507  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3506  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.154198  normal  0.0873465 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  21.12 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  25.48 
 
 		 239 aa  49.3  0.00004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2131  regulatory protein, TetR  27.7 
 
 		 218 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00771887  normal  0.859247 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3598  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 227 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.699465 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3380  regulatory protein, TetR  26.72 
 
 		 222 aa  48.5  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.386273  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0527  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 198 aa  48.9  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.18684  normal  0.990571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3199  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0468642  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3294  transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 198 aa  48.5  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.164572  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 191 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3099  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 222 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.296713  normal  0.219943 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  22.4 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4571  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 231 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1885  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 196 aa  47.8  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 211 aa  47.4  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4594  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  24.48 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2347  transcriptional regulator, TetR family  27.7 
 
 		 223 aa  46.6  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123383  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5711  TetR family transcriptional regulator  24.31 
 
 		 245 aa  47.4  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 212 aa  46.6  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1496  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000100434  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4221  TetR family transcriptional regulator  24.71 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.360052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1335  transcriptional regulator, TetR family  24.07 
 
 		 194 aa  46.6  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.293374 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2454  TetR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 185 aa  47  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  22.5 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4995  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.11542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07900  hypothetical protein  28.41 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.591065  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3413  transcriptional regulator, TetR family  27.56 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0612  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0377  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 224 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.528926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1000  TetR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1499  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0951967  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2832  transcriptional regulator, TetR family  26.36 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1020  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.13954 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3448  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1103  transcriptional regulator, TetR family  23.42 
 
 		 248 aa  45.8  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.575371  normal  0.523139 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3979  transcriptional regulator, TetR family  27.12 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.318215  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 212 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1339  transcriptional regulator, TetR family  25.17 
 
 		 308 aa  45.8  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.752137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3094  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3529  TetR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 224 aa  45.8  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2041  TetR family transcriptional regulator  25.28 
 
 		 211 aa  45.8  0.0004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5273  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 237 aa  45.8  0.0004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.461714  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>