67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_2300 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  416  9.999999999999999e-116  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  98.56 
 
 		 208 aa  410  1e-114  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  65.78 
 
 		 213 aa  257  1e-67  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  61.98 
 
 		 208 aa  245  4e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 236 aa  105  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 239 aa  98.6  5e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 239 aa  98.6  6e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  35.38 
 
 		 225 aa  92.4  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 239 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 239 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 239 aa  91.3  8e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 228 aa  64.7  0.0000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3953  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0396138  normal  0.024229 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3771  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 223 aa  54.7  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0893  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.17617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2037  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 234 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2007  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.175096  normal  0.641587 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1669  TetR family transcriptional regulator  24.68 
 
 		 235 aa  51.6  0.000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2599  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 233 aa  51.2  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.87329  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  27.5 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3689  TetR family transcriptional regulator  22.35 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 231 aa  49.3  0.00004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1666  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 209 aa  49.3  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.40268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  28.98 
 
 		 243 aa  48.9  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0012  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1248  AcrR family transcriptional regulator  25.32 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1985  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 269 aa  48.5  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.351825 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1048  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 198 aa  47.4  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 267 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1016  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00988275  normal  0.688061 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2438  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 208 aa  46.2  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3438  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 190 aa  45.8  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.547681  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  27.92 
 
 		 229 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5245  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 251 aa  45.4  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 203 aa  45.1  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 241 aa  45.1  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 201 aa  44.3  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 193 aa  44.7  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2490  transcriptional regulator, TetR family  24.64 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375188  normal  0.286749 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 200 aa  42.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0026  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 194 aa  42.7  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.348467  normal  0.209562 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2922  transcriptional regulator, TetR family  22.7 
 
 		 204 aa  42.4  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.404278 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 209 aa  42.4  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 206 aa  42.4  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3111  transcriptional regulator, TetR family  23.2 
 
 		 203 aa  42  0.006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.268901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  24.54 
 
 		 220 aa  42  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1801  transcriptional regulator, TetR family  22.41 
 
 		 216 aa  42  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 224 aa  42  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1542  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 215 aa  41.6  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1519  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 215 aa  41.6  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4729  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 240 aa  41.6  0.009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 248 aa  41.6  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2446  regulator AmrR  25.58 
 
 		 209 aa  41.6  0.01  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.584689  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2815  TetR family transcriptional regulator  24.83 
 
 		 242 aa  41.6  0.01  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.106176  normal  0.623336 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2985  TetR family transcriptional regulator  21.21 
 
 		 193 aa  41.6  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000207551  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3541  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 221 aa  41.6  0.01  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>