132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_3755 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  484  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  86.19 
 
 		 239 aa  421  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  85.65 
 
 		 239 aa  414  9.999999999999999e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  71.29 
 
 		 225 aa  309  2.9999999999999997e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  70.56 
 
 		 236 aa  301  7.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 219 aa  177  1e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 208 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 213 aa  89  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 208 aa  82.8  0.000000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0451  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 224 aa  57.4  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00762729  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  34.95 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 212 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 200 aa  52.4  0.000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 192 aa  52  0.000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 190 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  40.58 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 241 aa  51.2  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  32.97 
 
 		 192 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  32.2 
 
 		 223 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  36.67 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 196 aa  49.3  0.00005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 209 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  28 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 250 aa  48.9  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  33.63 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 224 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 244 aa  48.5  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 288 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0500  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 224 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4734  TetR family transcriptional regulator  28.03 
 
 		 242 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 210 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  27.82 
 
 		 257 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 237 aa  47.4  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 218 aa  46.6  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 204 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 195 aa  46.2  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  37.23 
 
 		 201 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 214 aa  46.2  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  24.5 
 
 		 190 aa  46.2  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 259 aa  45.4  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 259 aa  45.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 218 aa  45.4  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 209 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 211 aa  45.4  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  22.58 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 210 aa  45.1  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 200 aa  45.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 195 aa  45.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  30.59 
 
 		 220 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13232  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 228 aa  44.7  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.414971 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 215 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0919  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.563199 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 242 aa  45.1  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  26.19 
 
 		 203 aa  45.1  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5407  transcriptional regulator, TetR family  29.25 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.924589  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3512  regulatory protein TetR  27.88 
 
 		 237 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.58 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  24.32 
 
 		 207 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2807  regulatory protein TetR  29.59 
 
 		 202 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00102447  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 254 aa  43.9  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 204 aa  44.3  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  40.74 
 
 		 202 aa  43.9  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  25.4 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 185 aa  43.5  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2497  transcriptional regulator, TetR family  27.42 
 
 		 221 aa  43.5  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000693939 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7011  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 		 190 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394296  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  31.03 
 
 		 217 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  34.67 
 
 		 234 aa  42.7  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  21.05 
 
 		 192 aa  42.7  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1587  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 255 aa  43.1  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0494603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 207 aa  43.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 198 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 206 aa  42.7  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1473  TetR family transcriptional regulator  26 
 
 		 195 aa  42.7  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4113  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 236 aa  42.7  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 197 aa  42.7  0.005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>