166 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4300 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 236 aa  483  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  68.14 
 
 		 225 aa  310  1e-83  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 239 aa  305  3e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 239 aa  305  3e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  70.18 
 
 		 239 aa  305  3e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  66.67 
 
 		 239 aa  303  1.0000000000000001e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  66.52 
 
 		 239 aa  298  4e-80  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  46.23 
 
 		 219 aa  179  4e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  36.98 
 
 		 213 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 208 aa  105  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 208 aa  101  9e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 228 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  31.41 
 
 		 244 aa  61.6  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0100  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 288 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2226  TetR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 204 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 192 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  34 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0330  transcriptional regulator, TetR family  33.98 
 
 		 233 aa  52.8  0.000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 224 aa  52.8  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3736  transcriptional regulator, TetR family  25.61 
 
 		 210 aa  52  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 198 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 190 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1209  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0397499 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  31.13 
 
 		 257 aa  49.3  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2647  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 217 aa  48.9  0.00006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 212 aa  48.9  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 241 aa  49.3  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 195 aa  49.3  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6467  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 217 aa  48.9  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.146665  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3833  transcriptional regulator, TetR family  35.87 
 
 		 212 aa  48.9  0.00007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 204 aa  48.5  0.00008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3540  TetR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 250 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 221 aa  48.9  0.00008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1795  TetR family transcriptional regulator  24.24 
 
 		 224 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.141886 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3466  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  40.68 
 
 		 202 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8486  putative transcriptional regulator, TetR family  48.08 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.251281  normal  0.72211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  24.34 
 
 		 241 aa  47.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4251  transcriptional regulator, TetR family  31.37 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.22701  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3071  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  31.87 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 209 aa  47.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 195 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3148  transcriptional regulator, TetR family  43.14 
 
 		 310 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2217  TetR family transcriptional regulator  39.44 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9154  putative transcriptional regulator, TetR family  36.71 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.231214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1281  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 		 210 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.781108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3806  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 238 aa  46.2  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.65239  normal  0.316965 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 218 aa  46.6  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  23.72 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  23.72 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  23.72 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  23.72 
 
 		 195 aa  46.2  0.0005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03730  transcriptional regulator, TetR family  22.86 
 
 		 215 aa  45.8  0.0006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 307 aa  45.8  0.0006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1984  TetR family transcriptional regulator  25.86 
 
 		 196 aa  45.4  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3012  transcriptional regulator, TetR family  29.53 
 
 		 219 aa  45.4  0.0007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.367148  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  30.3 
 
 		 258 aa  45.4  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3995  transcriptional regulator, TetR family  42.31 
 
 		 197 aa  45.4  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.200757  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 205 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  38.89 
 
 		 213 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1647  TetR family transcriptional regulator  22 
 
 		 215 aa  45.4  0.0008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 197 aa  45.1  0.0009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1116  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.863597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 219 aa  44.7  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4962  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0320648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  32.08 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 		 211 aa  45.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  26.28 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 186 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5804  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000000100556  hitchhiker  0.000892453 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1204  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260768  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5533  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  23.08 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4701  TetR family transcriptional regulator  26.19 
 
 		 205 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000742649  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15250  transcriptional regulator, tetR family  35.71 
 
 		 218 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.110377  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  25.22 
 
 		 259 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 208 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35350  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.147408 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 206 aa  44.3  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>