281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1674 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 192 aa  384  1e-106  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  88.77 
 
 		 190 aa  336  9.999999999999999e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 224 aa  294  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 224 aa  294  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 206 aa  293  1e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  57.84 
 
 		 196 aa  201  8e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  52.69 
 
 		 201 aa  193  1e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  51.1 
 
 		 185 aa  177  8e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 193 aa  177  9e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 201 aa  176  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  49.48 
 
 		 193 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  46.52 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  48.12 
 
 		 198 aa  153  2e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  38.8 
 
 		 228 aa  138  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 200 aa  108  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  35.93 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 213 aa  101  6e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 204 aa  98.2  7e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 212 aa  97.1  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 248 aa  89.7  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  34.32 
 
 		 217 aa  85.1  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  33.86 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 202 aa  73.2  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 211 aa  68.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 243 aa  56.6  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  37.84 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 271 aa  53.9  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 		 206 aa  52.8  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 222 aa  52.8  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5319  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 239 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 225 aa  51.6  0.000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 239 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1794  TetR family transcriptional regulator  35.35 
 
 		 218 aa  52  0.000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3103  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.960941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3175  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 201 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  35.21 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0313  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.121906  hitchhiker  0.00929139 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 239 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 234 aa  49.7  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 220 aa  49.7  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3117  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.490432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 200 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4974  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 204 aa  49.7  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792599  normal  0.404801 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0130  TetR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1941  hypothetical protein  34.88 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000561308 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1034  TetR family transcriptional regulator  45.16 
 
 		 204 aa  48.9  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04039  hypothetical protein  33.71 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000282396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4455  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.10893e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4534  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5704  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 201 aa  48.9  0.00004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.013286 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3801  TetR family transcriptional regulator  33.71 
 
 		 215 aa  49.3  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000675626  normal  0.64863 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  30.38 
 
 		 207 aa  48.5  0.00005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 200 aa  48.5  0.00006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5155  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 		 201 aa  48.1  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  23.91 
 
 		 206 aa  48.1  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0199  TetR family regulatory protein  24.29 
 
 		 214 aa  48.1  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1225  TetR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.657492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3146  TetR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.303801  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2544  transcriptional regulator, TetR family  37.7 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.49291 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  43.86 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0406  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 206 aa  47.4  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0181245  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0184  TetR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 335 aa  47.4  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000505732  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1558  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0872  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.678947 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0008  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  40.62 
 
 		 222 aa  46.6  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1515  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.512381  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0011  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 248 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0646  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.545029 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0705  regulatory protein, TetR  40.35 
 
 		 211 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4747  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000342659  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0010  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.387363  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1287  regulatory protein, TetR  32 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1156  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1436  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0010  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1121  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0496337  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0412  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 212 aa  46.2  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.417244  normal  0.216002 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2565  transcriptional regulator, TetR family  29.55 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000672076  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0675  transcriptional regulator, TetR family  34.33 
 
 		 271 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.886772  normal  0.300779 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3227  transcriptional regulator, TetR family  33.67 
 
 		 204 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5045  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.906168  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1745  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  31.53 
 
 		 195 aa  45.8  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5815  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1792  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.651799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  39.68 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1726  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 216 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.379747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4364  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 206 aa  45.4  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0414  TetR family transcriptional regulator  26.87 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.462572  normal  0.0664832 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1242  transcriptional regulator, TetR-family  28.57 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>