68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3278 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3278  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2432  TetR family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 239 aa  186  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.625789 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2739  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 225 aa  181  6e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000589766  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4220  TetR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 239 aa  181  8.000000000000001e-45  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3755  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3767  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3828  TetR family transcriptional regulator  44.81 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 236 aa  174  8e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5230  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 228 aa  73.2  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2300  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2347  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 208 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0682211  normal  0.43856 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2339  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00249237 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2603  TetR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 208 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0626  TetR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 244 aa  55.1  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.852372 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1283  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 199 aa  54.3  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.255686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2178  TetR family transcriptional regulator  25.81 
 
 		 181 aa  51.6  0.000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000638624  hitchhiker  0.00000363527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.03 
 
 		 195 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  24.73 
 
 		 192 aa  48.9  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 192 aa  48.9  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  25.47 
 
 		 208 aa  48.5  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1045  transcriptional regulator, TetR family  21.71 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00830488  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  24.19 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  22.63 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2022  transcriptional regulator, TetR family  21.94 
 
 		 225 aa  47  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.613149  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 192 aa  47.4  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1590  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3198  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3207  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  24.19 
 
 		 192 aa  46.2  0.0004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  25.85 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3260  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 245 aa  46.2  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3910  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 242 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.104674 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5273  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 241 aa  45.8  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0264263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  23.66 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 288 aa  45.1  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  24.81 
 
 		 201 aa  45.1  0.0008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1516  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 218 aa  44.3  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.875223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  30.48 
 
 		 212 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5271  transcriptional regulator, TetR family  28.85 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  23.12 
 
 		 190 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  37.93 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3256  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.757999  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 307 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  24.32 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2878  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 223 aa  43.5  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53550  transcriptional regulator  32 
 
 		 227 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00980972  decreased coverage  0.0000958508 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3055  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 197 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.170203  normal  0.155543 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4693  transcriptional regulator  32 
 
 		 227 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1179  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 290 aa  42.7  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.669252  normal  0.155031 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1747  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 221 aa  42.4  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 237 aa  42.4  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0223  transcriptional regulator, TetR family  24.55 
 
 		 195 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000853805  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4181  transcriptional regulator, TetR family  24.5 
 
 		 227 aa  42  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000221958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4423  regulatory protein TetR  23.4 
 
 		 223 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.310024  normal  0.345836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2097  TetR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 186 aa  42  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.191848  normal  0.237667 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1909  transcriptional regulator, TetR family  19.62 
 
 		 197 aa  41.6  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1155  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 223 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.931412 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3447  regulatory protein TetR  31.63 
 
 		 199 aa  41.6  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3149  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 205 aa  41.6  0.01  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0403  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 204 aa  41.6  0.01  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.101074  normal  0.152412 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>