172 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4693 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_4693  transcriptional regulator  100 
 
 		 227 aa  460  1e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53550  transcriptional regulator  94.71 
 
 		 227 aa  436  1e-121  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00980972  decreased coverage  0.0000958508 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  68.72 
 
 		 223 aa  282  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  34.11 
 
 		 248 aa  61.6  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 204 aa  53.9  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 212 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0830  transcriptional regulator, TetR family  28.21 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38090  TetR-family transcriptional regulatory protein  32.74 
 
 		 221 aa  50.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0395776  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0444  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  30.08 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  51.11 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4939  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 203 aa  50.1  0.00003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3299  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 307 aa  49.7  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3846  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  49.7  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.213396  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3781  regulatory protein TetR  39.34 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0489772  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4502  TetR family transcriptional regulator  26.96 
 
 		 241 aa  49.3  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.595773 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3995  TetR family transcriptional regulator  26.61 
 
 		 243 aa  49.3  0.00005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4931  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 497 aa  49.3  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.475051  normal  0.080695 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8100  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 218 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978856  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4322  transcriptional regulator, TetR family  32.74 
 
 		 242 aa  48.5  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1927  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 198 aa  48.5  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6821  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 186 aa  48.5  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3949  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.549729 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1261  TetR family transcriptional regulator  26.11 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.100849  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0987  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1888  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  36.14 
 
 		 213 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 236 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  47.83 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3584  TetR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0103  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 210 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2609  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0815  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 207 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3625  regulatory protein TetR  30 
 
 		 191 aa  47.4  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0350  TetR family transcriptional regulator  29.71 
 
 		 194 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.378963  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06840  transcriptional regulator, tetR family  35.04 
 
 		 215 aa  47  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2507  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00142913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3328  TetR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.524569 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4596  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 204 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.887184 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2134  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 212 aa  47  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.175968 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4166  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 191 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15710  transcriptional regulator  29.33 
 
 		 221 aa  45.8  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.274511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 225 aa  45.8  0.0005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2366  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000270806  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1276  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 241 aa  46.2  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.296602  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0113  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 211 aa  45.8  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.987214  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0927  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.165233  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0730  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.110462  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4445  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 191 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.142911  normal  0.471705 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0653  TetR family transcriptional regulator  31.9 
 
 		 239 aa  45.8  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.895019 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  31.79 
 
 		 204 aa  45.4  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  28.7 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0889  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.760524  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0794  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0156861  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2993  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0998  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 191 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000315127  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  35.44 
 
 		 220 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0929  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.1215099999999997e-45 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5683  TetR family transcriptional regulator  25.16 
 
 		 189 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.17527  hitchhiker  0.003772 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0746  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 190 aa  45.4  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0743  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 192 aa  45.1  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.019038  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0834  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 191 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00423826  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0353  transcriptional regulator, TetR family  26.74 
 
 		 191 aa  45.1  0.0008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000439096  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 202 aa  45.1  0.0009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 251 aa  45.1  0.0009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3527  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0655225  normal  0.540257 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  37.74 
 
 		 189 aa  44.7  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03010  TetR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000381229 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1897  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 225 aa  44.7  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00350  transcriptional regulator  31.43 
 
 		 199 aa  44.7  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0227  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 247 aa  45.1  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.543112  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2695  transcriptional regulator, TetR family  26.53 
 
 		 226 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2247  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 227 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0328  putative transcriptional regulator  26.32 
 
 		 222 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.536324  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0267  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 217 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.173198  hitchhiker  0.00351225 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2285  TetR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 211 aa  44.7  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0118465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2401  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 223 aa  44.7  0.001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.853887 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2917  TetR family transcriptional regulator  26.85 
 
 		 218 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.761743  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6268  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 182 aa  45.1  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.700387  normal  0.409486 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  36.11 
 
 		 200 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 211 aa  43.5  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0068  TetR family transcriptional regulator  30.26 
 
 		 193 aa  43.9  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5058  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 221 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.519107  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4683  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 385 aa  44.3  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3213  transcriptional regulator, TetR family  26.11 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000469892  normal  0.140374 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  22.15 
 
 		 214 aa  43.5  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4029  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  30.93 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5437  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 209 aa  43.9  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.195882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  31.68 
 
 		 195 aa  44.3  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2226  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.145555  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>