167 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3167 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3167  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 213 aa  425  1e-118  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3152  transcriptional regulator, TetR family  46.74 
 
 		 248 aa  159  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262017  normal  0.121031 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3153  transcriptional regulator, TetR family  48.3 
 
 		 243 aa  138  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.12439 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4838  transcriptional regulator, TetR family  43.78 
 
 		 217 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2355  transcriptional regulator, TetR family  43.98 
 
 		 204 aa  123  3e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.284642  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3166  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 234 aa  122  4e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.335744  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4572  transcriptional regulator, TetR family  45.71 
 
 		 200 aa  116  3e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209013  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1840  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 213 aa  114  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0700993  normal  0.104485 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4885  putative transcriptional regulator, TetR family  38.86 
 
 		 202 aa  112  5e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0329972  normal  0.0964504 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5977  transcriptional regulator, TetR family  34.88 
 
 		 271 aa  110  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.414781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2521  TetR family transcriptional regulator  38.95 
 
 		 200 aa  108  9.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0320  transcriptional regulator, TetR family  50.44 
 
 		 206 aa  104  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5197  transcriptional regulator, TetR family  37.57 
 
 		 211 aa  101  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5079  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 190 aa  91.3  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1674  TetR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 192 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.344236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0353  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 228 aa  91.3  1e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0616658  normal  0.0838621 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1169  TetR family transcriptional regulator  31.12 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1914  TetR family transcriptional regulator  38.79 
 
 		 212 aa  85.1  8e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.183306 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5790  transcriptional regulator, TetR family  34.2 
 
 		 220 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0399068 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5094  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 201 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0170525  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5182  TetR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4890  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.218482 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5172  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  82.4  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.369972  normal  0.335335 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4507  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.916577  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4594  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 224 aa  82  0.000000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.60513  normal  0.70435 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5473  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 193 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.906106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10136  transcriptional regulator  32.08 
 
 		 201 aa  81.6  0.000000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.984674 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1103  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 185 aa  75.1  0.0000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.716955  normal  0.719209 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2639  transcriptional regulator, TetR family  33.73 
 
 		 196 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.302097  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5713  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 198 aa  71.2  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3363  regulatory protein TetR  30.46 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.268151  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0908  TetR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.376971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0515  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0187  regulatory protein TetR  49.09 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1142  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.627372  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0027  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 209 aa  50.8  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.790094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.01 
 
 		 207 aa  50.1  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1682  putative transcriptional regulator, TetR family  23.93 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.546444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0994  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 214 aa  49.3  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.146386  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53550  transcriptional regulator  37.35 
 
 		 227 aa  48.9  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00980972  decreased coverage  0.0000958508 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4693  transcriptional regulator  36.14 
 
 		 227 aa  48.1  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0402  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 219 aa  48.1  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.67084  normal  0.0771341 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3494  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0228  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.728602  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1848  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 210 aa  47  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 218 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0787  regulatory protein, TetR  31.06 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  26.51 
 
 		 204 aa  47.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5710  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 222 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.572132  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  24.58 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3839  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 251 aa  46.6  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.275978 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0731  TetR family transcriptional regulator  30.06 
 
 		 227 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0452  transcriptional regulator, TetR family  34.21 
 
 		 207 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1709  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 198 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1987  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.15936  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  46 
 
 		 230 aa  46.2  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0978  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 199 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7147  transcriptional regulator, TetR family  42.22 
 
 		 179 aa  45.8  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0957  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.962367  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0975  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 199 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0353361 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 192 aa  45.8  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 205 aa  45.8  0.0005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4631  TetR family transcriptional regulator  36.79 
 
 		 230 aa  45.8  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0355  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 195 aa  45.8  0.0005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12230  transcriptional regulator  50 
 
 		 199 aa  45.4  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2965  TetR family transcriptional regulator  24.53 
 
 		 175 aa  45.4  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  45.28 
 
 		 231 aa  45.4  0.0006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4936  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3897  TetR family transcriptional regulator  32.94 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3834  TetR family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 216 aa  45.4  0.0007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000963392 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 192 aa  45.4  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30200  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 231 aa  45.1  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.296423  normal  0.124528 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 212 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0765  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 196 aa  45.1  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.448904  normal  0.172153 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1305  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 181 aa  44.7  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  20.33 
 
 		 195 aa  44.3  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3117  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 248 aa  44.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1013  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 209 aa  44.7  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.421012  normal  0.993866 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  30.21 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  26.83 
 
 		 206 aa  44.7  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2209  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 205 aa  44.7  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.539658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1636  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 226 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.232227 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1669  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 225 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0413702  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 184 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2816  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 192 aa  43.5  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1924  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 210 aa  44.3  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.343626  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  25.41 
 
 		 211 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  20.33 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1244  TetR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218846 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0203  regulatory protein TetR  33.33 
 
 		 186 aa  43.9  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.041689  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  35.37 
 
 		 226 aa  43.5  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1486  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.260636  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0136  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 201 aa  43.1  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.563717  normal  0.436061 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5987  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9297  putative transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 		 198 aa  43.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.775461 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>