More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_4166 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_4166  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  392  1e-108  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3714  transcriptional regulator, TetR family  52.08 
 
 		 226 aa  53.1  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.576002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 213 aa  51.6  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  38.37 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 224 aa  51.2  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 194 aa  51.2  0.000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5655  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0301112  normal  0.0166104 
 
 
-
 
NC_003296  RS01892  transcription regulator protein  34.48 
 
 		 207 aa  50.4  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00576188  normal  0.449964 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  32.56 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 210 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3656  TetR family transcriptional regulator  37.78 
 
 		 223 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  37.33 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0726  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 203 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6487  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 195 aa  49.7  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 242 aa  49.3  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 196 aa  48.9  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3509  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1403  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 241 aa  48.5  0.00005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  35.16 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 206 aa  48.9  0.00005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  28.39 
 
 		 223 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1398  transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 195 aa  48.9  0.00005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 224 aa  48.5  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1360  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 270 aa  48.5  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100226  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 206 aa  48.5  0.00006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 236 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0138  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 218 aa  48.5  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010578  Bind_3907  regulatory protein TetR  48.94 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 208 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 243 aa  48.1  0.00008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 214 aa  48.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0441  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 198 aa  47.8  0.00009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.805705 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 187 aa  48.1  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 197 aa  47.8  0.00009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0611  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 203 aa  47.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.17 
 
 		 202 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  45.1 
 
 		 211 aa  47  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4456  regulatory protein TetR  38.1 
 
 		 202 aa  47.4  0.0001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0166479  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  41.07 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2200  transcriptional regulator, TetR family  36.23 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2540  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 220 aa  47  0.0002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.34282 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  47.92 
 
 		 231 aa  46.6  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1938  transcriptional regulator, TetR family  32.84 
 
 		 226 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.165177  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1071  DNA-binding transcriptional repressor AcrR  46.94 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0117133  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 204 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0724  transcriptional regulator, TetR family  34.62 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1981  TetR family transcriptional regulator  41.94 
 
 		 227 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0412771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1496  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 206 aa  47  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  53.06 
 
 		 324 aa  46.6  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6216  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5885  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 203 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.687121 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  28.47 
 
 		 210 aa  46.6  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 211 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3482  TetR family transcriptional regulator  44 
 
 		 248 aa  46.2  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0660414  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0196  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 233 aa  46.2  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6979  transcriptional regulator, TetR family  40.38 
 
 		 220 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.941023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4693  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 227 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.59 
 
 		 222 aa  45.8  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6228  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 194 aa  45.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.301912  normal  0.923303 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5198  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 193 aa  45.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0041  transcriptional regulator, TetR family  44 
 
 		 206 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.218146 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53550  transcriptional regulator  36.36 
 
 		 227 aa  45.8  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00980972  decreased coverage  0.0000958508 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28930  transcriptional regulator  31.46 
 
 		 205 aa  45.8  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.218384 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2365  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 213 aa  45.4  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227272  normal  0.96994 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2350  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000443807  hitchhiker  0.00368666 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  32.99 
 
 		 230 aa  45.4  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5257  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.570583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0612  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 202 aa  45.1  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.136679  normal  0.487596 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  32.94 
 
 		 228 aa  45.1  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1646  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 233 aa  45.1  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3317  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.305506  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0424  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 201 aa  45.1  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.315635  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1479  transcriptional regulator, TetR family  42.55 
 
 		 190 aa  45.1  0.0007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.210194  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4044  TetR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 214 aa  45.1  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 183 aa  44.7  0.0007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 291 aa  44.7  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0293  TetR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 203 aa  44.7  0.0008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000668888 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 200 aa  44.7  0.0008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3815  regulatory protein, TetR  37.25 
 
 		 252 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00651597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0612  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0141452  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6173  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 202 aa  44.7  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2556  transcriptional regulator, TetR family  28.05 
 
 		 208 aa  44.7  0.0009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00000000489141  normal  0.182844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1778  TetR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 199 aa  44.7  0.0009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0789135  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>