More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_0679 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0686  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
197 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.863349  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0679  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
197 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.192454  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0699  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
197 aa  389  1e-107  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.682068  normal  0.380548 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0059  TetR family transcriptional regulator  78.68 
 
 
197 aa  312  1.9999999999999998e-84  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.227701 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0855  TetR family transcriptional regulator  80.21 
 
 
196 aa  304  6e-82  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.179371  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 
200 aa  91.7  6e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1490  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1512  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1488  TetR family transcriptional regulator  33.51 
 
 
210 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0106  transcriptional regulator, TetR family  32.49 
 
 
227 aa  84.7  8e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5157  putative transcriptional regulator, TetR family  33.51 
 
 
233 aa  81.6  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.23435  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4373  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 
229 aa  72  0.000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.335963  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1317  regulatory protein TetR  31.12 
 
 
232 aa  69.3  0.00000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1797  transcriptional regulator, TetR family  33.83 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3271  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 
201 aa  60.8  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.377871  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1580  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000739015  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4182  TetR family transcriptional regulator  28.22 
 
 
201 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.368627  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1457  transcription regulator, TetR family  43.64 
 
 
195 aa  57.4  0.0000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000222834  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1405  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 
203 aa  57.4  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.520137 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33280  transcriptional regulator  35.58 
 
 
212 aa  57.4  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.815894  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4591  regulatory protein, TetR  33.63 
 
 
200 aa  57.8  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0937227  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3360  transcriptional regulator, TetR family  48.33 
 
 
194 aa  56.6  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.372466  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4400  regulatory protein TetR  38.38 
 
 
184 aa  57  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0700  TetR family transcriptional regulator  42.65 
 
 
178 aa  55.8  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.665559 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4203  TetR family transcriptional regulator  28.66 
 
 
216 aa  55.5  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0570722  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1791  regulatory protein, TetR  32.06 
 
 
246 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00350194  normal  0.153158 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0733  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0614739  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0727  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.329451 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0747  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 
205 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.15327 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3024  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
197 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101312  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 
211 aa  54.7  0.0000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1387  transcriptional regulator, TetR family  43.59 
 
 
213 aa  54.7  0.0000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0450  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 
201 aa  54.7  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1327  TetR family transcriptional regulator  44.23 
 
 
191 aa  54.3  0.000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385081  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3905  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
194 aa  53.9  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  35.21 
 
 
206 aa  54.3  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0969  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
195 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.610377  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0425  TetR family transcriptional regulator  34.31 
 
 
216 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5272  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
195 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2341  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 
206 aa  53.1  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.554096 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3656  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.311417  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2113  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.918403  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0303  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 
200 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00708396  normal  0.627467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4624  TetR family transcriptional regulator  26.49 
 
 
197 aa  53.1  0.000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0455  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 
224 aa  52.4  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.366206  normal  0.106872 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0942  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0072348  normal  0.323203 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1775  transcriptional regulator, TetR family  36.92 
 
 
255 aa  52.4  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0299  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0018  TetR family transcriptional regulator  31.71 
 
 
196 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1142  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 
202 aa  52.4  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.180703  normal  0.158777 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16280  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 
213 aa  52.4  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.450776  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0109  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
207 aa  52.8  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1735  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2807  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0031  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3533  transcriptional regulator, TetR family  34.65 
 
 
211 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.1353  normal  0.182077 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1989  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 
216 aa  52.4  0.000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3169  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
214 aa  52.4  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0472  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
206 aa  52  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.530719 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 
210 aa  52  0.000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
209 aa  52  0.000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  42.03 
 
 
191 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4466  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
193 aa  52  0.000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  43.08 
 
 
205 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
211 aa  51.6  0.000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  34.38 
 
 
208 aa  51.2  0.000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1400  putative transcriptional regulator  34.62 
 
 
213 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  43.08 
 
 
207 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2704  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 
203 aa  51.2  0.000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.187148 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4620  transcriptional regulator, TetR family  47.54 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.732833  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  36.92 
 
 
222 aa  50.8  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3614  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
218 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3793  regulatory protein TetR  43.16 
 
 
207 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3587  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
206 aa  50.4  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3628  TetR family transcriptional regulator  42.62 
 
 
214 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3603  TetR family transcriptional regulator  35.14 
 
 
214 aa  51.2  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6912  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
236 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.830717  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4191  TetR family transcriptional regulator  25.48 
 
 
236 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.513173  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3299  TetR family transcriptional regulator  39.29 
 
 
204 aa  50.8  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.168419 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3234  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.20483  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  34.38 
 
 
216 aa  51.2  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6550  transcriptional regulator, TetR family  30.43 
 
 
200 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000000124296  normal  0.0144339 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2606  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.613239  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5813  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 
243 aa  50.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.393234  hitchhiker  0.00386056 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3223  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1774  TetR family transcriptional regulator  38.55 
 
 
231 aa  50.8  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.277997  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0499  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4244  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 
212 aa  50.8  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.950938  n/a   
 
 
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NC_008705  Mkms_3285  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 
228 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.678887  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3416  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 
226 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180038  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0548  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_004347  SO_3277  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 
188 aa  49.7  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_007650  BTH_II0441  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 
233 aa  50.1  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013037  Dfer_3428  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 
223 aa  50.4  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0832031  normal 
 
 
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