197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3509 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3509  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 224 aa  437  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  27.44 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 188 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 206 aa  51.2  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  25.74 
 
 		 190 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1076  transcriptional regulator, TetR family  41.79 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.66869  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  48.15 
 
 		 219 aa  49.7  0.00003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4166  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 191 aa  49.7  0.00004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 202 aa  49.3  0.00004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 218 aa  48.9  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  35.14 
 
 		 208 aa  49.3  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 222 aa  49.3  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  34.09 
 
 		 212 aa  48.5  0.00009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3885  TetR family transcriptional regulator  21.76 
 
 		 242 aa  47.8  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4300  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 190 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4296  transcriptional regulator, TetR family  41.82 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1571  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 207 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0255  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 243 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.540416  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0432  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 214 aa  47.4  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0796504  hitchhiker  0.00000000967411 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 218 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1326  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 205 aa  47  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.892925  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1056  TetR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0248365  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1317  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.237455  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  42.11 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3360  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23870  transcriptional regulator  41.67 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  28.66 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1247  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3878  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0129032  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3932  putative transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 		 228 aa  46.2  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199219  normal  0.0173794 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 211 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  24.79 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1291  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 190 aa  46.2  0.0004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.170651  normal  0.326718 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 213 aa  46.2  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1297  TetR family transcriptional regulator  25.26 
 
 		 206 aa  45.8  0.0005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00583227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 235 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 223 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2044  transcriptional regulator, TetR family  42.37 
 
 		 217 aa  45.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5954  transcriptional regulator TetR family  33.75 
 
 		 219 aa  45.4  0.0006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 202 aa  45.8  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 211 aa  45.8  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0303  TetR family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130246 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08110  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 198 aa  45.4  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.792237 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 237 aa  45.4  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  43.94 
 
 		 213 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3341  TetR family transcriptional regulator  24.65 
 
 		 210 aa  45.1  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.113479  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05370  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 205 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000643211  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 295 aa  45.1  0.0008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2388  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  45.1  0.0009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  39.62 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2432  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0652024 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1391  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 208 aa  45.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0915  TetR family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 213 aa  44.7  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24840  putative transcriptional regulator  38.36 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2972  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419953  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  24.56 
 
 		 202 aa  44.7  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2634  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 209 aa  45.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.001775  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1993  transcriptional regulator, TetR family  35.09 
 
 		 223 aa  44.3  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1157  transcriptional regulator, TetR family  30.65 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0870204  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2986  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.741715  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3111  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 210 aa  44.7  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3130  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 216 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0949  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 286 aa  43.9  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0155  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 222 aa  43.9  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2460  transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 214 aa  44.3  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.953634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4666  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 200 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.243183 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 189 aa  43.9  0.002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1149  transcriptional regulator, TetR family protein  31.67 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3846  regulatory protein TetR  34.78 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24490  transcriptional regulator  38.24 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1167  regulatory protein TetR  30.38 
 
 		 220 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000000201787  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3801  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 206 aa  43.9  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.657762 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  31.4 
 
 		 212 aa  43.9  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  35.71 
 
 		 204 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1313  TetR family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2094  transcriptional regulator, TetR family  33.78 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000324065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8740  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 226 aa  43.9  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2105  putative transcriptional regulator  39.34 
 
 		 185 aa  43.5  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 264 aa  43.9  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7001  transcriptional regulator, TetR family  43.48 
 
 		 221 aa  43.5  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 188 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 223 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0144  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 224 aa  44.3  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.522541  decreased coverage  0.0000264507 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4104  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 438 aa  43.5  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>