More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0881 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  100 
 
 		 219 aa  433  1e-120  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  64.74 
 
 		 295 aa  254  6e-67  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  65.08 
 
 		 218 aa  249  2e-65  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  60.37 
 
 		 235 aa  246  2e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  64.74 
 
 		 223 aa  238  5e-62  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  63.43 
 
 		 206 aa  218  3.9999999999999997e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  61.71 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  58.2 
 
 		 208 aa  214  7e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  54.77 
 
 		 201 aa  211  5.999999999999999e-54  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  46.96 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  47.51 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  48.54 
 
 		 212 aa  143  3e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  47.7 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  47.7 
 
 		 223 aa  142  5e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  47.47 
 
 		 223 aa  135  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 213 aa  118  6e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  38.55 
 
 		 199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 237 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 201 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  36.81 
 
 		 201 aa  90.9  1e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 209 aa  89.4  4e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  34.48 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  31.76 
 
 		 190 aa  79  0.00000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5007  TetR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 239 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.908463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  34.13 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  32.82 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  28.3 
 
 		 251 aa  55.8  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  57.45 
 
 		 218 aa  55.5  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3442  TetR family transcriptional regulator  27.89 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.747618  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 72 aa  53.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3604  TetR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 204 aa  53.5  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.657199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5460  TetR family transcriptional regulator  30.81 
 
 		 206 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 222 aa  52.8  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 216 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  37.66 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  35 
 
 		 400 aa  52.4  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  31.5 
 
 		 219 aa  52.4  0.000006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 212 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4215  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 269 aa  52  0.000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.261755 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 224 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  28.23 
 
 		 209 aa  51.6  0.000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 226 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 		 250 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  37.1 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 205 aa  50.4  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  48.33 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 195 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  36.08 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 229 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  54.17 
 
 		 224 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 206 aa  50.1  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  47.73 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3509  TetR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 224 aa  49.7  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.05 
 
 		 201 aa  49.3  0.00004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24200  transcriptional regulator, tetR family  35.29 
 
 		 204 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.130166  normal  0.0410828 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 236 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 208 aa  49.7  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1420  transcriptional regulator, TetR family  30.68 
 
 		 212 aa  49.7  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  39.29 
 
 		 194 aa  48.9  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 213 aa  48.9  0.00006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  40.79 
 
 		 231 aa  48.9  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28390  transcriptional regulator  32.46 
 
 		 195 aa  48.9  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  42 
 
 		 208 aa  48.9  0.00006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0236  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0269868  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0246  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0226  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.131166 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  46.81 
 
 		 230 aa  48.5  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  23.19 
 
 		 188 aa  48.5  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 210 aa  48.5  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3418  transcriptional regulator protein  33.82 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 195 aa  48.5  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  42.86 
 
 		 193 aa  48.5  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  43.4 
 
 		 212 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6563  putative transcriptional regulator, TetR family  44.29 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0113679 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5908  TetR family transcriptional regulator  30.86 
 
 		 200 aa  48.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.889059 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1520  TetR family transcriptional regulator  38.16 
 
 		 207 aa  47.8  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  39.62 
 
 		 204 aa  48.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4643  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609609  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  26.67 
 
 		 194 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7736  putative transcriptional regulator, TetR family  28.9 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.97147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3720  TetR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0838127 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 239 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  39.47 
 
 		 230 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 204 aa  47.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>