160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3995 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 191 aa  390  1e-108  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  66.67 
 
 		 202 aa  236  1e-61  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  30.6 
 
 		 209 aa  73.6  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  28.19 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  31.43 
 
 		 219 aa  59.3  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  28.4 
 
 		 190 aa  57.8  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  53.85 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  46.03 
 
 		 206 aa  54.3  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  44.44 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 295 aa  52  0.000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 223 aa  51.2  0.000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 235 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 218 aa  51.2  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  40.51 
 
 		 218 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 223 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 213 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  34.21 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1673  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 216 aa  47.8  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.947806  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 237 aa  47.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  39.68 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2304  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 225 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.808365 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2029  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 220 aa  45.8  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.107784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 223 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1838  transcriptional regulator, TetR family  38.57 
 
 		 221 aa  46.2  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.834516  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 215 aa  45.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 190 aa  45.8  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0429  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 		 213 aa  45.8  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0148562 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 203 aa  45.8  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0050  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 210 aa  45.4  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  24.85 
 
 		 206 aa  45.4  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 190 aa  45.4  0.0005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1665  transcriptional regulator, TetR family  40.35 
 
 		 223 aa  45.1  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.117381  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 201 aa  45.1  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  37.7 
 
 		 195 aa  45.1  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3546  transcriptional regulator, TetR family  34.83 
 
 		 206 aa  45.1  0.0006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.726096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  36.21 
 
 		 208 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0928  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 184 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.312785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 199 aa  45.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  44.23 
 
 		 197 aa  44.7  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2342  regulatory protein, TetR  25.62 
 
 		 216 aa  44.7  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.391158 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  23.53 
 
 		 200 aa  44.7  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4533  transcriptional regulator, TetR family  35.59 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0585795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3999  regulatory protein, TetR  29.49 
 
 		 258 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0360  TetR family transcriptional regulator  37.29 
 
 		 193 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 196 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5284  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 217 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5054  TetR family transcriptional regulator  42.19 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.817621 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5318  transcriptional regulator, TetR family  45.61 
 
 		 197 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2095  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.546455  normal  0.514839 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2306  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2111  transcriptional regulator, TetR family  33.8 
 
 		 214 aa  44.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.780559 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1140  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 242 aa  43.9  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00144314 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  43.1  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1493  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 198 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2853  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.788684  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0309  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 184 aa  43.9  0.002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.312076  normal  0.149076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 		 242 aa  43.5  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 223 aa  43.1  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 208 aa  43.1  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5992  transcriptional regulator, TetR family  26.83 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.396143  normal  0.47391 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  24.85 
 
 		 217 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2367  TetR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 202 aa  43.1  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.445055  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 206 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 188 aa  43.9  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  38.46 
 
 		 212 aa  43.1  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5768  putative transcriptional regulator, TetR family  38.33 
 
 		 239 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.51365  normal  0.452434 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 195 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2047  transcriptional regulator, TetR family  37.04 
 
 		 188 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.199455 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 200 aa  43.1  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 219 aa  42.7  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 227 aa  42.7  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 207 aa  42.7  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 226 aa  43.1  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3286  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 192 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>