180 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3500 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  69.19 
 
 		 209 aa  242  1.9999999999999999e-63  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  35.62 
 
 		 212 aa  105  5e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 208 aa  89.4  3e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  36.31 
 
 		 237 aa  85.9  4e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 295 aa  85.1  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 218 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 218 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 218 aa  84.3  9e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  35.5 
 
 		 199 aa  81.3  0.000000000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 235 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  31.76 
 
 		 219 aa  79  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  29.03 
 
 		 206 aa  77.8  0.00000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 213 aa  76.3  0.0000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 223 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  61.6  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 223 aa  59.7  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 201 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 72 aa  52.4  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3889  transcriptional regulator, TetR family  33.64 
 
 		 299 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.110513  normal  0.292317 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1681  TetR family transcriptional regulator  29.66 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.977422 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  28.81 
 
 		 202 aa  48.9  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3327  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 185 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.11213  normal  0.13372 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0327  TetR family transcriptional regulator  32.26 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.159849 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  25.53 
 
 		 201 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13324  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 221 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.119785  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4653  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4652  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4421  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4260  transcriptional regulator  32 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4272  transcriptional regulator  32 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4762  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4637  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  46.34 
 
 		 215 aa  48.1  0.00007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4633  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 195 aa  48.1  0.00007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.169287  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1640  TetR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 216 aa  48.1  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.305588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0602  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 195 aa  47.8  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  32.47 
 
 		 251 aa  47.4  0.0001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3225  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4353  TetR family transcriptional regulator  32 
 
 		 195 aa  47.4  0.0001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4516  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4487  transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 207 aa  46.6  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1734  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 207 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0246488  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1452  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 199 aa  46.6  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3721  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 200 aa  47  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.522362  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2344  TetR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 195 aa  46.6  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  0.958906 
 
 
-
 
NC_003296  RS05498  putative transcription regulator protein  33.33 
 
 		 197 aa  46.2  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.806773 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3313  transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 209 aa  46.2  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0137945 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  36.62 
 
 		 218 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10067  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.504189 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4464  transcriptional regulator, TetR family  60 
 
 		 188 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129958  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 189 aa  45.8  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0133  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 191 aa  45.8  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14044 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0414  TetR family transcriptional regulator  22.03 
 
 		 202 aa  45.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2219  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 207 aa  45.8  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.23135  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4437  TetR family transcriptional regulator  46 
 
 		 192 aa  45.8  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19730  transcriptional regulator, tetR family  35.94 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.453369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 196 aa  45.4  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4327  regulatory protein, TetR  50 
 
 		 182 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.809003  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0597  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1936  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 193 aa  45.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6680  transcriptional regulator, TetR family  44.44 
 
 		 176 aa  45.1  0.0006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.933684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  27.78 
 
 		 185 aa  45.1  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  58.54 
 
 		 218 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3838  transcriptional regulator TetR family  42.55 
 
 		 230 aa  44.7  0.0009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.606304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2242  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.640782  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2176  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000096918  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2162  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116975  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2406  TetR family transcriptional regulator  48.84 
 
 		 209 aa  43.9  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  47.37 
 
 		 205 aa  43.9  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 214 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  60.61 
 
 		 208 aa  43.9  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 190 aa  43.9  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2108  TetR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0371  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 227 aa  44.3  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  46.94 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2796  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 231 aa  43.9  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.252593 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3643  TetR family transcriptional regulator  51.52 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.259475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2423  transcriptional regulator, TetR family  48.84 
 
 		 207 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0403  transcriptional regulator, TetR family  47.62 
 
 		 213 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.472446  normal  0.522596 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 196 aa  44.3  0.001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  55.88 
 
 		 250 aa  43.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1551  TetR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 178 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.826028  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0141  nucleoid occlusion protein  41.86 
 
 		 219 aa  43.1  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.102052  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2959  transcriptional regulator, TetR family  46.51 
 
 		 207 aa  43.5  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00177797 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4802  TetR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.96494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 236 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 203 aa  43.5  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>