More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4799 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
218 aa  440  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  92.66 
 
 
235 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  94.01 
 
 
223 aa  396  1e-109  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  87.79 
 
 
295 aa  381  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  65.08 
 
 
219 aa  250  9.000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  66.11 
 
 
206 aa  246  3e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  64.44 
 
 
206 aa  240  9e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  59.04 
 
 
208 aa  227  9e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  55.9 
 
 
201 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  51.4 
 
 
223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  52.51 
 
 
223 aa  172  2.9999999999999996e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  52.02 
 
 
223 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  52.02 
 
 
223 aa  169  3e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
223 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  42.62 
 
 
212 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 
237 aa  122  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 
199 aa  108  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 
213 aa  108  8.000000000000001e-23  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
209 aa  95.5  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  37.58 
 
 
201 aa  93.6  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  36.94 
 
 
201 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  32.78 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 
190 aa  84.7  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  29.32 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 
72 aa  56.2  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  35.65 
 
 
193 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 
212 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3442  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
212 aa  53.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.747618  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 
197 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  24.14 
 
 
251 aa  53.9  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  36.26 
 
 
219 aa  53.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  42.42 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.14 
 
 
236 aa  52.8  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 
224 aa  52.8  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  35.56 
 
 
287 aa  52.8  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
195 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 
190 aa  52.4  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
250 aa  52.8  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
226 aa  52.4  0.000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 
203 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  41.54 
 
 
229 aa  52  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 
203 aa  52  0.000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  56.25 
 
 
224 aa  52  0.000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
204 aa  52  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
202 aa  52  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  45.9 
 
 
205 aa  52  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  40.98 
 
 
206 aa  51.6  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 
218 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  24.49 
 
 
195 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
206 aa  50.8  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
224 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 
200 aa  51.6  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  44.62 
 
 
196 aa  50.8  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 
223 aa  50.8  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  48.08 
 
 
191 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 
192 aa  51.2  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4782  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.682663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 
194 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  30.7 
 
 
222 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  45.76 
 
 
216 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 
208 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2128  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 
201 aa  50.4  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.544484  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  36.63 
 
 
221 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  33.01 
 
 
239 aa  49.7  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  40.98 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4577  TetR family transcriptional regulator  22.83 
 
 
247 aa  49.7  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3533  TetR family transcriptional regulator  28.97 
 
 
237 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0909277  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
237 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
237 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
230 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 
210 aa  48.5  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 
204 aa  48.9  0.00007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5087  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
259 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5773  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
259 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
227 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  46.55 
 
 
230 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4405  TetR family transcriptional regulator  32.65 
 
 
259 aa  48.5  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.630882  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  40.62 
 
 
218 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
203 aa  48.5  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1074  transcriptional regulator, TetR family  21.05 
 
 
184 aa  48.1  0.00009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  38.33 
 
 
212 aa  48.1  0.00009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  30.77 
 
 
278 aa  48.1  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 
200 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 
204 aa  48.1  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  43.75 
 
 
202 aa  48.1  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2186  TetR family transcriptional regulator  43.55 
 
 
214 aa  47.4  0.0001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0785456  normal  0.820524 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  43.48 
 
 
208 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  40.51 
 
 
198 aa  48.1  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 
203 aa  48.1  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1616  transcriptional regulator, TetR family  48 
 
 
224 aa  47.8  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.86283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0064  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 
242 aa  47  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.261244 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
212 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>