More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_2871 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 213 aa  415  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  73.2 
 
 		 237 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  60.32 
 
 		 199 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  59.69 
 
 		 201 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  39.89 
 
 		 201 aa  121  6e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  36.62 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  48.72 
 
 		 212 aa  115  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 218 aa  108  8.000000000000001e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 235 aa  104  8e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 295 aa  104  9e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 223 aa  102  6e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 206 aa  97.4  1e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 209 aa  97.1  2e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  37.2 
 
 		 206 aa  97.1  2e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  34.55 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  30.11 
 
 		 223 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 223 aa  82  0.000000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 190 aa  76.3  0.0000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  31.55 
 
 		 223 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  38.82 
 
 		 251 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 201 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  38.04 
 
 		 212 aa  58.2  0.00000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  45.57 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  52.17 
 
 		 216 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  47.69 
 
 		 202 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0034  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0043  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00545933 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  30.49 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0024  TetR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.823038 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  43.24 
 
 		 226 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  53.7 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  52.83 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03670  transcriptional regulator  46.88 
 
 		 230 aa  55.1  0.0000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00912022  hitchhiker  0.0085588 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2654  regulatory protein TetR  31.08 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1098  TetR family transcriptional regulator  37.36 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0976848 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2600  TetR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 185 aa  54.3  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4442  TetR family transcriptional regulator  36.56 
 
 		 192 aa  54.3  0.000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.75286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  36.54 
 
 		 242 aa  54.3  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 207 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 231 aa  54.3  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  51.85 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 		 202 aa  53.5  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  51.85 
 
 		 224 aa  53.5  0.000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06720  transcriptional regulator, TetR family  33.77 
 
 		 221 aa  53.1  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  34.41 
 
 		 229 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0771  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.353788  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3359  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 192 aa  52.8  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000478711  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2600  transcriptional regulator, TetR family  34.85 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  47.17 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  44.59 
 
 		 259 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2301  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 197 aa  52.8  0.000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  44.9 
 
 		 72 aa  52.8  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1173  regulatory protein, TetR  36.11 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.959952 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1862  transcriptional regulator, TetR family  29.47 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.349014  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1090  transcriptional regulator, TetR family  33.12 
 
 		 204 aa  52.4  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141216  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5370  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 187 aa  52.4  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  36.51 
 
 		 291 aa  52.4  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  33.93 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2372  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2165  putative transcriptional regulator, TetR family  34.94 
 
 		 215 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.367605  normal  0.919137 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 212 aa  52.4  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  41.33 
 
 		 195 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5999  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 215 aa  52  0.000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 206 aa  52.4  0.000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0675  regulatory protein, TetR  36.99 
 
 		 220 aa  52  0.000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  42.86 
 
 		 196 aa  52  0.000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  31.78 
 
 		 222 aa  51.6  0.000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  27.37 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2557  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  51.6  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15322e-23 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2104  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 191 aa  51.6  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.230608 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2362  TetR family transcriptional regulator  26.74 
 
 		 179 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2545  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0577985  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2366  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.711286  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3058  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000151008  decreased coverage  0.0000000705144 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2282  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 236 aa  50.8  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2508  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 209 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  25.74 
 
 		 195 aa  51.2  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1381  transcriptional regulator, TetR family  22.22 
 
 		 184 aa  51.6  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.419771  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4803  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.539659  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  34.72 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2134  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 205 aa  51.6  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.269562  normal  0.11419 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2353  TetR family transcriptional regulator  34.85 
 
 		 217 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.384863  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  36.59 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  39.08 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>