More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4839 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
223 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
223 aa  438  9.999999999999999e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  80.66 
 
 
223 aa  286  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  82.32 
 
 
223 aa  280  2e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  74.65 
 
 
223 aa  270  2e-71  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  47.66 
 
 
295 aa  185  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  51.37 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  51.37 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  51.37 
 
 
218 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 
235 aa  179  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  49.46 
 
 
223 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  47.09 
 
 
219 aa  158  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  45.66 
 
 
206 aa  141  6e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  45.09 
 
 
206 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  43.5 
 
 
208 aa  138  7e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  41.4 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  36.99 
 
 
212 aa  105  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  32.86 
 
 
237 aa  94  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  32.07 
 
 
213 aa  91.7  9e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  32.62 
 
 
199 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 
201 aa  86.7  2e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
201 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 
209 aa  85.9  5e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 
201 aa  74.7  0.000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 
190 aa  68.6  0.00000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  31.41 
 
 
208 aa  63.5  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  33.64 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  32.45 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  31.97 
 
 
221 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.84 
 
 
212 aa  57  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 
72 aa  55.8  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  41.79 
 
 
229 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 
207 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
203 aa  53.9  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2911  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 
248 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.109038 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
216 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
218 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  38.33 
 
 
251 aa  53.1  0.000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  43.06 
 
 
208 aa  52.4  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1173  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
218 aa  52.4  0.000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4278  transcriptional regulator, TetR family  46.48 
 
 
199 aa  52.4  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4514  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
202 aa  52  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603185  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3341  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
196 aa  52  0.000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  45.71 
 
 
214 aa  51.6  0.000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1277  transcriptional regulator, TetR family  34.51 
 
 
211 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0101868  normal  0.0726815 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  34.78 
 
 
193 aa  51.6  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
297 aa  51.2  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0032  transcriptional regulator, TetR family  34.18 
 
 
210 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
202 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1965  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 
206 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0526053  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1045  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 
226 aa  51.2  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.446098  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2868  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
184 aa  51.2  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.0239599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0521  putative transcriptional regulator, TetR family  37.31 
 
 
215 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
257 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  34.67 
 
 
253 aa  50.4  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0914  transcriptional regulatory protein  31.78 
 
 
210 aa  50.8  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.626019  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  39.44 
 
 
206 aa  50.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2402  transcriptional regulator, TetR family  30.14 
 
 
259 aa  50.4  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0404395  hitchhiker  0.00830545 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 
191 aa  50.1  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6158  TetR family transcriptional regulator  38.1 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.488727  normal  0.104212 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3576  TetR-like virulence regulator  42.59 
 
 
207 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 
195 aa  50.1  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3347  regulatory protein, TetR  42.59 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.235212  normal  0.0210246 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  40.3 
 
 
196 aa  50.1  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 
202 aa  49.7  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.326335 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  38.1 
 
 
203 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3101  TetR family transcriptional regulator  31.31 
 
 
230 aa  48.9  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.359837  normal  0.83525 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2011  transcriptional regulator, TetR family  31.65 
 
 
213 aa  49.3  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.27798 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1903  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 
208 aa  49.3  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.712719  normal  0.266183 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5445  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5417  TetR family transcriptional regulator  28.27 
 
 
225 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.618934  decreased coverage  0.00324744 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1129  TetR family transcriptional regulator  30.36 
 
 
231 aa  48.9  0.00006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0177  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
190 aa  48.5  0.00007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1526  TetR family transcriptional regulator  39.39 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0534186  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  38.98 
 
 
206 aa  48.5  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2456  transcriptional regulator, TetR family  23.48 
 
 
211 aa  48.5  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0797268  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  46.67 
 
 
224 aa  48.5  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5174  putative transcriptional regulator, TetR family  41.46 
 
 
199 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0107413  hitchhiker  0.00860579 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  42.42 
 
 
205 aa  48.5  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  41.67 
 
 
193 aa  48.1  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 
212 aa  48.5  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2647  TetR family transcriptional regulator  41.89 
 
 
74 aa  48.5  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 
236 aa  47.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5366  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
210 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  hitchhiker  0.00158369  normal  0.823764 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3185  TetR family transcriptional regulator  46.3 
 
 
208 aa  48.1  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.579993  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  40.68 
 
 
206 aa  47.8  0.0001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1957  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 
194 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.292651 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 
250 aa  47.8  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25560  transcriptional regulator  44.44 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4307  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
214 aa  47.8  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188393  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 
291 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 
209 aa  47.8  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  38.24 
 
 
218 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  41.38 
 
 
207 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4852  TetR family transcriptional regulator  42.11 
 
 
225 aa  47.8  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.651579  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 
203 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  31.34 
 
 
212 aa  47.4  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>