More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13607 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 295 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  91.63 
 
 		 218 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  91.63 
 
 		 218 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  91.63 
 
 		 218 aa  379  1e-104  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  84.3 
 
 		 235 aa  375  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  84.02 
 
 		 223 aa  365  1e-100  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  64.74 
 
 		 219 aa  254  1.0000000000000001e-66  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  62.78 
 
 		 206 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  61.67 
 
 		 206 aa  234  2.0000000000000002e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  56.91 
 
 		 208 aa  222  6e-57  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  54.87 
 
 		 201 aa  206  3e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4581  TetR family transcriptional regulator  50.29 
 
 		 223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.19483 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4839  TetR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 223 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.370984  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4927  TetR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 223 aa  169  8e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0321  TetR family transcriptional regulator  51.45 
 
 		 223 aa  169  8e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.950858 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4586  TetR family transcriptional regulator  50 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.330892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  42.08 
 
 		 212 aa  147  2.0000000000000003e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8200  putative transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3645  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 199 aa  105  8e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.529358  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  34.25 
 
 		 213 aa  104  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0324  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 201 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.867461  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0334  TetR family transcriptional regulator  37.42 
 
 		 201 aa  96.3  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.611067  normal  0.230945 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1634  TetR family transcriptional regulator  31.47 
 
 		 209 aa  95.5  9e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.681802  normal  0.225704 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0313  TetR family transcriptional regulator  36.77 
 
 		 201 aa  95.1  1e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  33.88 
 
 		 208 aa  85.9  7e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3500  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 190 aa  85.1  0.000000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.242129  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0392  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 201 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.022112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6580  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 242 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.603144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3176  transcriptional regulator, TetR family  32.19 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00199059 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  20.96 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 218 aa  54.3  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6871  TetR family transcriptional regulator  55.17 
 
 		 224 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.405099  normal  0.0580493 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0828  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04380  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 72 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 236 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  54 
 
 		 216 aa  53.1  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 194 aa  53.5  0.000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  46.15 
 
 		 212 aa  53.5  0.000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 206 aa  52.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 200 aa  52.8  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1826  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 250 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0995188  normal  0.24055 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1028  transcriptional regulator, TetR family  29.46 
 
 		 200 aa  52.8  0.000008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0479484  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3774  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 202 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1320  transcriptional regulator, TetR family  53.45 
 
 		 224 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4737  TetR family transcriptional regulator  53.45 
 
 		 224 aa  52.4  0.000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3360  putative transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 195 aa  52.4  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0575014  normal  0.0807522 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2583  TetR family transcriptional regulator  56.25 
 
 		 226 aa  52  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.176518 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3995  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 191 aa  52  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6309  putative transcriptional regulator, TetR family  32.28 
 
 		 197 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.407991  normal  0.0813971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 208 aa  51.6  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3442  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 212 aa  51.2  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.747618  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 204 aa  51.6  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2080  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 219 aa  51.2  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.740876  hitchhiker  0.00831587 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1772  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 202 aa  51.2  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.706828  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37080  transcriptional regulator  39.34 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0966  transcriptional regulator, TetR family  40.32 
 
 		 218 aa  50.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00645846  normal  0.836206 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1763  TetR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 221 aa  50.4  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2460  transcriptional regulator TetR family  33.65 
 
 		 231 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2572  transcriptional regulator, TetR family  30.88 
 
 		 208 aa  50.8  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2103  TetR family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  40.91 
 
 		 195 aa  50.8  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2869  transcriptional regulator, TetR family  37.68 
 
 		 192 aa  50.8  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 203 aa  50.8  0.00003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  24.24 
 
 		 278 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3330  TetR family transcriptional regulator  30.14 
 
 		 221 aa  50.4  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.537262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5281  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 257 aa  50.4  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4094  TetR family transcriptional regulator  35.9 
 
 		 204 aa  50.1  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0325183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0873  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 196 aa  49.3  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.682179 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  37.04 
 
 		 194 aa  49.3  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 205 aa  48.9  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3919  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 209 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.738583 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3806  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 209 aa  48.9  0.00009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.238661 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0960  TetR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 206 aa  48.9  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.462033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 229 aa  48.5  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  40.82 
 
 		 193 aa  48.9  0.0001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3503  TetR family transcriptional regulator  40.85 
 
 		 198 aa  48.9  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  44.44 
 
 		 191 aa  48.5  0.0001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2181  transcriptional regulator, TetR family  35.85 
 
 		 189 aa  47.8  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000940073  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  39.47 
 
 		 218 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4837  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6635  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 214 aa  48.1  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2116  transcriptional regulator, TetR family  29.05 
 
 		 192 aa  48.1  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 222 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4925  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.733021  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0323  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 227 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.939407  normal  0.953553 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 287 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4584  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4579  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.28011 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  26.21 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1770  transcriptional regulator, TetR family  34.04 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  26.77 
 
 		 212 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  35 
 
 		 223 aa  47.4  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5551  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.1306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  32.99 
 
 		 202 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2672  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 208 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  39.71 
 
 		 209 aa  47.4  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  41.3 
 
 		 203 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1922  transcriptional regulator, TetR family  32.47 
 
 		 201 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>