84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3442 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3442  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 212 aa  429  1e-119  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.747618  normal  0.0679711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5098  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.11151 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4799  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  23.62 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0881  regulatory protein TetR  27.89 
 
 		 219 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4713  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 218 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  24.63 
 
 		 201 aa  52.8  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4466  transcriptional regulator, TetR family  21.25 
 
 		 204 aa  51.6  0.000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.575375  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 295 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4876  transcriptional regulator, TetR family  31.62 
 
 		 209 aa  51.6  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.217727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5312  TetR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0775512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2823  TetR family transcriptional regulator  40.74 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.133482  normal  0.0456725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1459  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.568759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8533  putative transcriptional regulator, TetR family  24.84 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00958176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4473  putative transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.446518  normal  0.220039 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0384  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 225 aa  49.3  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0153  TetR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 205 aa  48.5  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10564  normal  0.9984 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3788  transcriptional regulator, TetR family  31.71 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2625  regulatory protein, TetR  37.04 
 
 		 206 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232365  normal  0.311906 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0245  transcriptional regulator  43.48 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0104  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 198 aa  48.1  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0973  TetR family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.342069 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5636  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 202 aa  47.4  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.500793 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  29.91 
 
 		 203 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6209  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 208 aa  46.6  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0795  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 219 aa  46.2  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1942  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 253 aa  46.2  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.338038  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2114  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 193 aa  45.8  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1637  transcriptional regulator, TetR family  24.26 
 
 		 227 aa  45.8  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0178246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0794  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 205 aa  45.4  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1512  regulatory protein, TetR  37.31 
 
 		 246 aa  45.4  0.0007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 223 aa  45.1  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0143  transcriptional regulator  37.29 
 
 		 264 aa  45.1  0.0009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0543  TetR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 203 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.889127 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0117  TetR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0667  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 200 aa  44.3  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000042492  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0132  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3298  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0118  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.980303  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1862  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0108  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  44.3  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1758  transcriptional regulator of TetR family protein  26.92 
 
 		 220 aa  44.7  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.77056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2937  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2011  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.542781  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04680  transcriptional regulator  37.5 
 
 		 225 aa  43.9  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6767  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.979262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3827  transcriptional regulator, TetR family  27.48 
 
 		 190 aa  43.5  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2924  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 204 aa  43.9  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1623  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1677  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.786941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0992  TetR family transcriptional regulator  22.73 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4783  transcriptional regulator, TetR family  28.44 
 
 		 201 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.697373  normal  0.690259 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1079  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 215 aa  43.5  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 219 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0121  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 202 aa  43.5  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000229  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 242 aa  43.5  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1218  transcriptional regulator, TetR family  38.6 
 
 		 206 aa  43.1  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0161  TetR family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 221 aa  43.1  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0566  transcriptional regulator, TetR family  25.98 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8864  transcriptional regulator, TetR family  22.52 
 
 		 202 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2136  transcriptional regulator, TetR family  24.81 
 
 		 212 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.547172  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0008  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 195 aa  43.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.643837 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2559  transcriptional regulator, TetR family  23.48 
 
 		 191 aa  43.1  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.927467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2316  transcriptional regulator, TetR family  29.89 
 
 		 220 aa  42.7  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.166278  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1920  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 213 aa  42.7  0.004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1244  TetR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 206 aa  42.7  0.004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0798  transcriptional regulator, TetR family  29.69 
 
 		 194 aa  42.4  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  25.17 
 
 		 225 aa  42  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1939  TetR family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 257 aa  42  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4071  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 193 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0294777  normal  0.94431 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3641  TetR family transcriptional regulator  38.3 
 
 		 200 aa  42  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.798229 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3406  putative transcriptional regulator, TetR family  38.18 
 
 		 222 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.472724 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0118  TetR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 222 aa  42  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0955  TetR family transcriptional regulator  23.97 
 
 		 218 aa  42  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2525  transcriptional regulator, TetR family  35.19 
 
 		 214 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0239  TetR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 229 aa  42  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5563  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 246 aa  42  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.811394 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1845  TetR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 237 aa  41.6  0.008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 233 aa  41.6  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3297  TetR family transcriptional regulator  47.37 
 
 		 232 aa  41.6  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1018  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 205 aa  41.6  0.009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 207 aa  41.6  0.009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1359  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 218 aa  41.6  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6284  regulatory protein, TetR  36.36 
 
 		 195 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>