More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2695 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_2695  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 204 aa  427  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.945572  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6365  putative transcriptional regulator, TetR family  28.25 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.277737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7752  putative transcriptional regulator, TetR family  28.11 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0658  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.609022  normal  0.929409 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0280  TetR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 196 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02619  transcriptional regulator  30.29 
 
 		 217 aa  61.6  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3720  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.91394  normal  0.0177543 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1591  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.194821 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1553  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1725  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 194 aa  57.8  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3341  transcriptional regulator, TetR family  27.08 
 
 		 226 aa  57  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2881  transcriptional regulator, TetR family  21.11 
 
 		 367 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3170  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 202 aa  56.2  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.148676  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5896  transcriptional regulator  25.28 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371414  normal  0.0197091 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3098  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 225 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.243755  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1798  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 194 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1601  TetR family transcriptional regulator  25.65 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.105676  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1775  transcriptional regulator, TetR family  25.65 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5621  transcriptional regulator, TetR family  24.71 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00254336 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7448  transcriptional regulator, TetR family  23.98 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.58477 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3744  transcriptional regulator, TetR family  26.24 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3421  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.288907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  28.95 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2589  transcriptional regulator BetI  23.81 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1087  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 215 aa  53.9  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.9461  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0870  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 186 aa  54.3  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65823  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2737  TetR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 220 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  27.62 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1074  transcriptional regulator BetI  25.26 
 
 		 195 aa  53.5  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000226822  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4328  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2529  transcriptional regulator, TetR family  24.24 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000510912 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4300  TetR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 236 aa  52.8  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.459951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1394  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 185 aa  52.8  0.000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.546688  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2158  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3681  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 234 aa  52.8  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2742  transcriptional regulator, TetR family  36.17 
 
 		 207 aa  52.4  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1866  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2004  transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.028996  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0880  transcriptional regulator, TetR family  43.86 
 
 		 212 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.987052  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0059  transcriptional regulator, TetR family  21.97 
 
 		 194 aa  52.4  0.000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00007304  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22630  transcriptional regulator  22.17 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3212  TetR family transcriptional regulator  26.03 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2959  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.878802  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3003  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 204 aa  52  0.000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.384269 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3714  TetR family transcriptional regulator  23.96 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4596  regulatory protein TetR  44.64 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3308  transcriptional regulator BetI  39.29 
 
 		 196 aa  52  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0697  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 		 191 aa  51.6  0.000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1756  transcriptional regulator, TetR family  43.64 
 
 		 205 aa  51.6  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000229906 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2557  TetR family transcriptional regulator  42.37 
 
 		 250 aa  51.6  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.705718  normal  0.759568 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4915  transcriptional regulator, TetR family  24.75 
 
 		 206 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.259096  normal  0.574827 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2974  TetR family transcriptional regulator  35.63 
 
 		 204 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.329725  normal  0.021189 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02851  putative transcriptional repressor for the cellular response to osmotic stress (TetR/AcrR family) protein  29.59 
 
 		 186 aa  51.6  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13607  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 295 aa  51.6  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.20276 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2422  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 197 aa  51.6  0.000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000265027  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6827  putative transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0995041 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0916  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0327012  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3316  transcriptional regulator, TetR family  45.28 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.655704  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0375  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00292447  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1835  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1923  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00275068  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2034  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 216 aa  51.2  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.480509  normal  0.0875613 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2977  transcriptional regulator, TetR family  24.18 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0181  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3630  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 203 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0460373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2527  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 207 aa  50.8  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1426  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 195 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.80296  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0390  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 230 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0466  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5184  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.14696  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0538  putative transcription regulator protein  39.66 
 
 		 340 aa  50.4  0.00002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0548249  normal  0.54431 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0565  transcriptional regulator BetI  28.04 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.359685 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1586  TetR family transcriptional regulator  37.25 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.377059  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  29.87 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 		 245 aa  50.1  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4585  transcriptional regulator, TetR family  41.54 
 
 		 220 aa  50.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.448621  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3538  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0555  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5035  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.496722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3179  regulatory protein, TetR  36.92 
 
 		 215 aa  50.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.323857 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0119  TetR family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000566826  decreased coverage  0.00000000000241144 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3352  TetR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 211 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.586652  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3270  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4510  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1139  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 220 aa  50.4  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0501486 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003766  predicted transcriptional regulator for fatty acid degradation FadQ TetR family  35.71 
 
 		 214 aa  50.4  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5098  transcriptional regulator BetI  39.62 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  28.26 
 
 		 194 aa  50.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4463  transcriptional regulator, TetR family  33.85 
 
 		 198 aa  49.7  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0418  transcriptional regulator, TetR family  39.66 
 
 		 352 aa  49.7  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340149  hitchhiker  0.000146207 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16790  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 212 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.297454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3850  TetR family transcriptional regulator  22.91 
 
 		 207 aa  49.7  0.00003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.349935 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>