More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00482 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  100 
 
 		 194 aa  404  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013456  VEA_001979  transcriptional regulator TetR family  74.73 
 
 		 193 aa  298  4e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.507988  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2554  TetR family transcriptional regulator  61.29 
 
 		 198 aa  241  3.9999999999999997e-63  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000394239  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0091  HTH-type transcriptional regulator, TetR family  54.55 
 
 		 199 aa  213  9.999999999999999e-55  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.903201  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0359  TetR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 203 aa  129  3e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4326  TetR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 202 aa  125  5e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 198 aa  122  3e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  39.25 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4148  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  120  9e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.677229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0373  TetR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 188 aa  119  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  37.77 
 
 		 191 aa  111  7.000000000000001e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1848  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00246548 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2371  transcriptional regulator, TetR family  33.16 
 
 		 190 aa  103  2e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0185343  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0332  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 192 aa  99.8  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00337125  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3436  transcriptional regulator, TetR family  32.46 
 
 		 194 aa  92.8  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.262135  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2698  TetR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 203 aa  90.9  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3500  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 		 191 aa  87.8  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00541119  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0808  TetR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 191 aa  87.4  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.287096 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3431  transcriptional regulator, TetR family  31.02 
 
 		 189 aa  86.7  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0286  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 186 aa  83.2  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1461  TetR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 197 aa  78.2  0.00000000000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.0279876 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2286  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000280215 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0270  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 192 aa  75.1  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.522665  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2991  TetR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0384605  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2997  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000711023  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2954  transcriptional regulator, TetR family  27.6 
 
 		 188 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.68265  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0787  TetR family transcriptional regulator  26.59 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0101484 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2951  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.418779999999999e-31 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2742  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.845467  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2692  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0469224  n/a   
 
 
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NC_006274  BCZK2671  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.083497  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2951  TetR family transcriptional regulator  26.42 
 
 		 188 aa  69.3  0.00000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3104  TetR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 194 aa  68.6  0.00000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.428011 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0179  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0807108  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2743  TetR family transcriptional regulator  27.08 
 
 		 188 aa  67  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.673676  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3151  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3252  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3717  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  29.37 
 
 		 197 aa  63.9  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3558  TetR family transcriptional regulator  27.13 
 
 		 190 aa  62.4  0.000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410356 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0871  TetR family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1417  TetR family transcriptional regulator  25.41 
 
 		 194 aa  62  0.000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.22703  n/a   
 
 
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NC_009718  Fnod_0166  TetR family transcriptional regulator  28.39 
 
 		 193 aa  62  0.000000006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.141555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3684  TetR family transcriptional regulator  25.13 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  37.93 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1006  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 189 aa  60.5  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1027  transcriptional regulator, TetR family  27.94 
 
 		 201 aa  59.7  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  27.46 
 
 		 189 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
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NC_007796  Mhun_1236  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0369519 
 
 
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NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
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NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
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NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  37.84 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2856  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 194 aa  58.5  0.00000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.661308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12528  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0275989 
 
 
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NC_009052  Sbal_3333  TetR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011830  Dhaf_4522  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.828993  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4300  transcriptional regulator  47.76 
 
 		 225 aa  58.2  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1941  transcriptional regulator, TetR family  30.1 
 
 		 194 aa  57.8  0.00000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000874649  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1039  TetR family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 201 aa  57.8  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.747573 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0583  regulatory protein, TetR  28.89 
 
 		 197 aa  58.2  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2983  TetR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4065  TetR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8965  putative transcriptional regulator, TetR family  29.29 
 
 		 173 aa  57.4  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3632  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3705  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2551  TetR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.48532  normal  0.51431 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3637  TetR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 207 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.262942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 203 aa  57  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3765  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 213 aa  56.6  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.0357958 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3358  TetR family transcriptional regulator  24.64 
 
 		 190 aa  57  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0464  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4092  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  30.11 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0557  regulatory protein TetR  37.04 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4306  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 		 202 aa  55.8  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.651969  normal  0.688785 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1288  TetR family transcriptional regulator  24.66 
 
 		 215 aa  55.8  0.0000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0315957  hitchhiker  0.00536276 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0066  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 193 aa  55.5  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3965  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0604  TetR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.229279 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3459  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 324 aa  55.5  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000855252 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  30.09 
 
 		 191 aa  54.7  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  46.43 
 
 		 185 aa  55.1  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1135  putative transcriptional regulator  29.94 
 
 		 215 aa  54.7  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.135048  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3984  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 216 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.765993  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  26.39 
 
 		 194 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011353  ECH74115_1926  transcriptional regulator EefR  40.62 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0902915  hitchhiker  0.0000000455593 
 
 
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NC_007954  Sden_0974  regulatory protein, TetR  29.93 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010498  EcSMS35_1837  transcriptional regulator EefR  40.62 
 
 		 188 aa  53.9  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000033131 
 
 
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NC_008463  PA14_12440  AcrR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 215 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.446651  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_08440  transcriptional regulator, TetR family  46.3 
 
 		 190 aa  53.9  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013132  Cpin_5422  transcriptional regulator, TetR family  34.74 
 
 		 198 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.650952  normal  0.302282 
 
 
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NC_013411  GYMC61_1468  transcriptional regulator, TetR family  24.53 
 
 		 190 aa  53.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009720  Xaut_1150  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
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NC_012803  Mlut_21920  transcriptional regulator  29.17 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.048177  n/a   
 
 
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NC_009675  Anae109_1039  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 190 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011899  Hore_05020  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 203 aa  52.8  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011901  Tgr7_2644  putative transcriptional regulator, TetR family  50 
 
 		 205 aa  52.4  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  48 
 
 		 205 aa  52  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
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