More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmz1t_2495 on replicon NC_011662
Organism: Thauera sp. MZ1T



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 287 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  42.13 
 
 		 211 aa  143  3e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  36.52 
 
 		 197 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  38.89 
 
 		 215 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 204 aa  89  9e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  34.08 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 204 aa  85.1  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  33.05 
 
 		 227 aa  84.3  0.000000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 225 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  31.44 
 
 		 188 aa  81.3  0.00000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  32.09 
 
 		 202 aa  80.9  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 211 aa  80.1  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0832  transcriptional regulator, TetR family  31.63 
 
 		 211 aa  77  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.933061 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1571  TetR family transcriptional regulator  34.91 
 
 		 201 aa  77  0.0000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.038411 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0033  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 256 aa  76.6  0.0000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 210 aa  75.5  0.0000000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16730  transcriptional regulator, TetR family  28.18 
 
 		 213 aa  75.5  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  28.89 
 
 		 215 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 207 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3642  TetR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 227 aa  73.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.494269 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  29.83 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1867  transcriptional regulator, TetR family  29.13 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.129849  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 204 aa  72  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  26.9 
 
 		 240 aa  72  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0445  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 209 aa  71.2  0.00000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.740524  decreased coverage  0.00376288 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4290  transcriptional regulator, TetR family  29.61 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000567463  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 207 aa  70.5  0.00000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 209 aa  70.1  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2755  TetR family transcriptional regulator  25.84 
 
 		 200 aa  69.7  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  29.51 
 
 		 195 aa  69.7  0.00000000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 239 aa  69.7  0.00000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 224 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1823  TetR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.331222  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  29.56 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0571  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 219 aa  68.2  0.0000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.22949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0684  TetR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 213 aa  68.6  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.974708 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.84 
 
 		 225 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 224 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1804  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1011  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 770 aa  67.4  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6295  transcriptional regulator, TetR family  26.94 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  27.96 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4802  TetR family transcriptional regulator  28.72 
 
 		 199 aa  67.8  0.0000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.386552  normal  0.120275 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4073  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1827  regulatory protein, TetR  30.34 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  30.51 
 
 		 227 aa  66.6  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1592  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0760  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 192 aa  66.6  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0913287  normal  0.16222 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5019  Integrase catalytic region  30.43 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.679371  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16700  transcriptional regulator  40.45 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  30.93 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3836  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 246 aa  65.9  0.0000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.487675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0061  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 187 aa  64.7  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  29.08 
 
 		 210 aa  65.1  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1933  AcrR family transcriptional regulator  48 
 
 		 243 aa  65.1  0.000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.189914  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4172  TetR family transcriptional regulator  27.09 
 
 		 205 aa  65.5  0.000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928216  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5962  Integrase catalytic region  30.83 
 
 		 350 aa  65.1  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.454691  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0503  TetR family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0363  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0103  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 190 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0503  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 193 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3516  Integrase catalytic region  30.83 
 
 		 350 aa  64.3  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.359482  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 210 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.107312  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  29.06 
 
 		 214 aa  64.7  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 205 aa  63.5  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17960  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6430  Integrase catalytic region  44.21 
 
 		 345 aa  63.5  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0663611 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0375  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0366  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.100088  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_1775  transcriptional regulator, TetR family  24.86 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0389  TetR family transcriptional regulator  29.28 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1218  TetR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0433  transcriptional regulator, TetR family  29.28 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  26.88 
 
 		 189 aa  62.8  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  27.65 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  37.8 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009972  Haur_1014  TetR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 212 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 222 aa  61.6  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
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NC_013510  Tcur_2723  transcriptional regulator, TetR family  27.69 
 
 		 224 aa  62  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0252111  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_4040  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 191 aa  62  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013411  GYMC61_2499  transcriptional regulator, TetR family  25.91 
 
 		 208 aa  62  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  36 
 
 		 215 aa  62  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
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NC_008781  Pnap_2515  TetR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 202 aa  62  0.00000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.326335 
 
 
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NC_011898  Ccel_2161  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 204 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.18 
 
 		 217 aa  61.2  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
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NC_012793  GWCH70_2502  transcriptional regulator, TetR family  25.16 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_4588  transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 		 206 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.112472 
 
 
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NC_009486  Tpet_0104  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 190 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3482  TetR family transcriptional regulator  33.93 
 
 		 191 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.342598  normal  0.760921 
 
 
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NC_012791  Vapar_1240  transcriptional regulator, TetR family  26.8 
 
 		 211 aa  61.6  0.00000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.567777  n/a   
 
 
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