More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7312 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7312  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 210 aa  431  1e-120  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4464  TetR family transcriptional regulator  64.17 
 
 		 204 aa  260  8.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0680244 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 210 aa  131  7.999999999999999e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 211 aa  127  8.000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2767  TetR family transcriptional regulator  30.48 
 
 		 225 aa  102  5e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.284138 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 195 aa  99  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5045  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 197 aa  84.7  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.820553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3049  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 214 aa  84.3  0.000000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0433  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 204 aa  83.6  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.376909  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  29.03 
 
 		 211 aa  80.5  0.00000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0595  TetR family transcriptional regulator  27.32 
 
 		 204 aa  80.9  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0043  regulatory protein, TetR  33.91 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1898  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 239 aa  79.3  0.00000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.643398 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2348  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 222 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0187157  normal  0.0306872 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4691  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.771858  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4777  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.681727  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5076  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 215 aa  77.4  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.175697 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3508  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 227 aa  75.9  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.343043  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2768  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 224 aa  75.5  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.379756  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  29.67 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2065  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 		 188 aa  74.3  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.704626  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1909  transcriptional regulator, TetR family  29.59 
 
 		 209 aa  73.2  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0574085  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 287 aa  73.2  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  29.12 
 
 		 225 aa  73.2  0.000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3248  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 201 aa  71.6  0.000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6181  transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.685616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3944  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 215 aa  70.9  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5283  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 208 aa  70.9  0.00000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.261053 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2055  putative transcriptional regulator, TetR family  28.36 
 
 		 229 aa  70.1  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2688  TetR family transcriptional regulator  28.73 
 
 		 207 aa  69.3  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.357002  normal  0.760245 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0293  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 226 aa  68.6  0.00000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2765  regulatory protein, TetR  28.72 
 
 		 210 aa  68.2  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.267077  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2269  putative transcriptional regulator  28.34 
 
 		 207 aa  67.8  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.629172  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26580  transcriptional regulator, TetR family  25.51 
 
 		 205 aa  67.8  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0994293 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1145  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  26.89 
 
 		 224 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26760  putative transcriptional regulator  28.88 
 
 		 198 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2924  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.288766  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1436  TetR family transcriptional regulator  28.11 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0281  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.645912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3991  regulatory protein TetR  27.81 
 
 		 197 aa  65.1  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  25.6 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1483  TetR family transcriptional regulator  29.95 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3352  transcriptional regulator, TetR family  26.87 
 
 		 183 aa  64.3  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0512596  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3920  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 227 aa  63.2  0.000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.62554  normal  0.13671 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4938  transcriptional regulator, TetR family  25.94 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.262917  normal  0.206147 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13590  TetR family transcriptional regulator  27.03 
 
 		 200 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.332381  normal  0.0844747 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4222  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.42669  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0806  transcriptional regulator, TetR family  28.93 
 
 		 202 aa  62.4  0.000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.265645  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4288  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.458199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4600  TetR family transcriptional regulator  28.35 
 
 		 221 aa  62.4  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0411306  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3833  transcriptional regulator, TetR family  26.42 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2213  putative transcription regulator transcription regulator protein  27.54 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2109  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.901149 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2801  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20320  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0347  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 200 aa  58.5  0.00000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0154637  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2799  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.364827  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1471  TetR family transcriptional regulator  26.04 
 
 		 219 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2233  transcriptional regulator, TetR family  27.49 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0329344  normal  0.539811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0626  TetR family transcriptional regulator  26.63 
 
 		 215 aa  56.6  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0807  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.271007  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1515  putative transcriptional regulator, TetR family  28.3 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254086  hitchhiker  0.00363064 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 207 aa  55.5  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2017  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 236 aa  53.9  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1603  transcriptional regulator, TetR family  23.63 
 
 		 189 aa  54.3  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0115969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33190  transcriptional regulator  25 
 
 		 202 aa  53.9  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.284512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0306  TetR family transcriptional regulator  22.66 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0641939  normal  0.172302 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14200  transcriptional regulator, TetR family  42.5 
 
 		 227 aa  53.9  0.000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0000918467  decreased coverage  0.00704922 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4378  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2483  transcriptional regulator, TetR family  25.53 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000117416  hitchhiker  0.00899265 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1369  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.859804 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5488  TetR family transcriptional regulator  25.85 
 
 		 238 aa  53.1  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7768  putative transcriptional regulator, TetR family  25.28 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0117  TetR family transcriptional regulator  24.18 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.966538  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2816  hypothetical protein  28.11 
 
 		 222 aa  52.4  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0366008  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1061  transcriptional regulator, TetR family  26.85 
 
 		 196 aa  52.8  0.000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0250707  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0992  putative transcriptional regulator of paa operon  30.51 
 
 		 208 aa  52.8  0.000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.332152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0788  TetR family transcriptional regulator  24.48 
 
 		 221 aa  52  0.000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.796627 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0056  transcriptional regulator, TetR family  39.51 
 
 		 198 aa  52  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  44.23 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  28.25 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1746  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 195 aa  51.6  0.000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10308  TetR/AcrR family transcriptional regulator  41.79 
 
 		 210 aa  51.6  0.000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000336223  normal  0.125099 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3493  TetR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 222 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.50615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5380  TetR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 197 aa  50.8  0.00001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.768843  normal  0.61228 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  46.34 
 
 		 332 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0772  transcriptional regulator, TetR family  26.25 
 
 		 223 aa  51.2  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5720  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 291 aa  51.2  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.649137  normal  0.760569 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2696  TetR family transcriptional regulator  24.74 
 
 		 196 aa  51.2  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.834085 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0615  TetR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 140 aa  50.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3827  putative transcriptional regulator  42.11 
 
 		 216 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0370  TetR family transcriptional regulator  25.12 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0234884  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0329  transcriptional regulator, TetR family  34.07 
 
 		 196 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.330162  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6560  transcriptional regulator, TetR family  47.92 
 
 		 203 aa  50.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1958  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.455038  normal  0.501183 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  46.94 
 
 		 232 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2628  transcriptional regulator, TetR family  23.5 
 
 		 194 aa  50.4  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00732346  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>