More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3984 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 200 aa  414  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  45.81 
 
 		 204 aa  190  1e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  45.45 
 
 		 203 aa  145  6e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 202 aa  134  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 248 aa  105  6e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  40.18 
 
 		 307 aa  101  6e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  40.18 
 
 		 333 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 215 aa  98.6  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  37.57 
 
 		 207 aa  97.8  9e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 219 aa  97.1  1e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 207 aa  96.3  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  30.51 
 
 		 193 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 203 aa  91.3  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  28.64 
 
 		 199 aa  89  4e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 257 aa  89.4  4e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 208 aa  88.6  6e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  27.84 
 
 		 184 aa  86.3  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  27.75 
 
 		 203 aa  84.7  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 		 223 aa  84.7  8e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  38.46 
 
 		 199 aa  82.4  0.000000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 224 aa  81.3  0.000000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 197 aa  78.6  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  77  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 194 aa  75.1  0.0000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 214 aa  75.1  0.0000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  27.84 
 
 		 203 aa  75.1  0.0000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  34.82 
 
 		 197 aa  73.9  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  27.43 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  28.57 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0827  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 200 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 206 aa  70.1  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  26.99 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  28.66 
 
 		 184 aa  69.3  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  33.93 
 
 		 197 aa  69.3  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  27.17 
 
 		 214 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 195 aa  67.8  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  28.83 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2716  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.448471  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  26.9 
 
 		 228 aa  65.9  0.0000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  23.15 
 
 		 209 aa  65.5  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1242  TetR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 212 aa  65.1  0.0000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000053734  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 208 aa  64.7  0.0000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  25.84 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 214 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  36.56 
 
 		 287 aa  63.5  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 		 241 aa  62.8  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.15 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 195 aa  62.4  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 206 aa  62  0.000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  25.86 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  27.95 
 
 		 186 aa  61.6  0.000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  28.73 
 
 		 199 aa  61.2  0.000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 209 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 221 aa  60.5  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  25.45 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  27.27 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  26.52 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  25.88 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  44.64 
 
 		 218 aa  58.9  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  24.36 
 
 		 204 aa  58.5  0.00000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3817  transcriptional regulator, TetR family  29.73 
 
 		 223 aa  58.5  0.00000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.131002  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0635  transcription regulator protein  31.82 
 
 		 216 aa  58.5  0.00000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1501  regulatory protein TetR  25.37 
 
 		 210 aa  58.5  0.00000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0856799  normal  0.774912 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  24.72 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  28.43 
 
 		 205 aa  58.2  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  29.5 
 
 		 175 aa  58.2  0.00000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.51 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 249 aa  57.8  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 217 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  24 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  22.65 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5073  transcriptional regulator TetR family  29.63 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.479761  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  25.23 
 
 		 235 aa  56.2  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  29.52 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 212 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0040  transcriptional regulator, TetR family  32 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  23.66 
 
 		 204 aa  55.8  0.0000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007337  Reut_D6485  regulatory protein, TetR  26.85 
 
 		 278 aa  55.8  0.0000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.521213  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3745  transcriptional regulator, TetR family  25.63 
 
 		 201 aa  55.8  0.0000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  27.68 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  22.63 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>