More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmar_1709 on replicon NC_013501
Organism: Rhodothermus marinus DSM 4252



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 207 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  41.24 
 
 		 207 aa  129  3e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 204 aa  104  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 248 aa  100  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 203 aa  97.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 219 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  32.92 
 
 		 203 aa  97.1  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  31.91 
 
 		 200 aa  96.3  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 215 aa  95.1  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 223 aa  94.7  9e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  34.56 
 
 		 333 aa  94.4  1e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  32.44 
 
 		 307 aa  94  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  36.08 
 
 		 214 aa  92.8  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 203 aa  92  6e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 203 aa  91.7  7e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  36.47 
 
 		 207 aa  90.9  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 203 aa  90.5  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 206 aa  89.7  2e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  32.62 
 
 		 257 aa  87.4  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 224 aa  85.1  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 230 aa  84.3  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.89 
 
 		 203 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  31.05 
 
 		 199 aa  82.8  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  30.57 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 217 aa  79.3  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  29.21 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 206 aa  76.6  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  40.82 
 
 		 197 aa  77  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  27.32 
 
 		 199 aa  75.9  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  28.35 
 
 		 196 aa  75.9  0.0000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  36.69 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 217 aa  75.5  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  28.72 
 
 		 229 aa  75.1  0.0000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 226 aa  75.5  0.0000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  32.64 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 		 222 aa  74.7  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 196 aa  74.7  0.0000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  23.71 
 
 		 205 aa  74.7  0.0000000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 234 aa  74.7  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  29.27 
 
 		 190 aa  74.7  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 214 aa  74.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  29.05 
 
 		 215 aa  73.6  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  29.27 
 
 		 199 aa  73.2  0.000000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 199 aa  72.4  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  30.57 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 204 aa  72  0.000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4897  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 231 aa  72  0.000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.043246  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 209 aa  72  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 196 aa  71.6  0.000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 210 aa  70.5  0.00000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  30.37 
 
 		 212 aa  68.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 216 aa  68.6  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  31.53 
 
 		 217 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  29.7 
 
 		 205 aa  67  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  30.67 
 
 		 184 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  28.42 
 
 		 238 aa  67  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 209 aa  67.4  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  31.4 
 
 		 232 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2354  TetR family transcriptional regulator  27.18 
 
 		 205 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0147944  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  26.9 
 
 		 206 aa  66.2  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  30.95 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5095  transcriptional regulator, TetR family  38.38 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.666558  normal  0.638711 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  31.33 
 
 		 212 aa  65.5  0.0000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  34.68 
 
 		 249 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2846  regulatory protein, TetR  29.7 
 
 		 227 aa  64.7  0.0000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  32.04 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  30.5 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  26.95 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  33.73 
 
 		 197 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  31.77 
 
 		 192 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  28.35 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  28.12 
 
 		 204 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 224 aa  63.5  0.000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0987  regulatory protein TetR  40 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.383045  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 		 208 aa  63.9  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 184 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 264 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  27.67 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  31.08 
 
 		 193 aa  63.2  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  22.51 
 
 		 195 aa  63.5  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  27.54 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  35.05 
 
 		 197 aa  62  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  36.27 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3149  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 233 aa  62  0.000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 295 aa  61.6  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 197 aa  61.6  0.000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 199 aa  61.6  0.000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>