More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00523 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  100 
 
 		 200 aa  410  1e-114  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  42.41 
 
 		 195 aa  151  7e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  28.14 
 
 		 208 aa  74.7  0.0000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 209 aa  72.8  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 206 aa  69.7  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  27.39 
 
 		 196 aa  65.9  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  27.67 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 184 aa  62  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  26.95 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  26.88 
 
 		 184 aa  62  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 204 aa  61.6  0.000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.54 
 
 		 230 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  25.26 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2986  regulatory protein, TetR  29.25 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1456  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  28.03 
 
 		 181 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 192 aa  58.9  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  24.19 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4636  transcriptional regulator, TetR family  26.5 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.100753  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 237 aa  58.2  0.00000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37020  transcriptional regulator, TetR family  27.78 
 
 		 276 aa  58.2  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.016957 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  24.38 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  25.14 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  29.52 
 
 		 236 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  28.27 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 207 aa  57  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  35.37 
 
 		 390 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  26.04 
 
 		 232 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  27.61 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1283  transcriptional regulator, TetR family  41.27 
 
 		 212 aa  55.8  0.0000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0196213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  26.43 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1822  putative transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  27.33 
 
 		 200 aa  55.5  0.0000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  24.38 
 
 		 228 aa  55.1  0.0000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  24.2 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 193 aa  55.1  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 222 aa  55.1  0.0000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  26.92 
 
 		 224 aa  53.9  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 218 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 240 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1260  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.194739 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  27.39 
 
 		 222 aa  53.5  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  24.72 
 
 		 257 aa  53.9  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1052  TetR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.857726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  26.29 
 
 		 209 aa  53.5  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  28.79 
 
 		 180 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.75 
 
 		 202 aa  53.1  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  23.75 
 
 		 208 aa  53.1  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2316  transcriptional regulator, TetR family  30.16 
 
 		 234 aa  53.1  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  25.95 
 
 		 278 aa  52.4  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  30.25 
 
 		 203 aa  52.8  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 206 aa  52.4  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  26.95 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4146  transcriptional regulator, TetR family  27.87 
 
 		 246 aa  52.4  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 249 aa  52.8  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.19 
 
 		 200 aa  52.4  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  25.77 
 
 		 229 aa  52.8  0.000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 215 aa  52  0.000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3212  TetR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 223 aa  52.4  0.000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.59703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2800  TetR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 201 aa  52.4  0.000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 248 aa  52  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 202 aa  52  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 225 aa  52  0.000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  25.6 
 
 		 194 aa  52  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2134  transcriptional regulator, TetR family  32.76 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00399747  normal  0.0273951 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  24.38 
 
 		 216 aa  52  0.000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 203 aa  51.6  0.000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  25.44 
 
 		 193 aa  51.6  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  41.51 
 
 		 223 aa  51.6  0.000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0339  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  24 
 
 		 221 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2871  TetR family transcriptional regulator  28.46 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  25.9 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  27.34 
 
 		 225 aa  51.2  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  23.89 
 
 		 207 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6613  TetR family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 254 aa  50.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0518  TetR family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 206 aa  50.4  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290772  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 191 aa  50.4  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0265  TetR family transcriptional regulator  45.61 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00630944 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2205  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.270822 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0237  transcriptional regulator  23.78 
 
 		 175 aa  50.1  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000134845  hitchhiker  0.00000000249443 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.48 
 
 		 264 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 202 aa  50.1  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4482  TetR family transcriptional regulator  32.22 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3609  transcriptional regulator, TetR family  26.03 
 
 		 228 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0817  TetR family transcriptional regulator  44.07 
 
 		 332 aa  49.7  0.00003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8390  putative transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  28.71 
 
 		 201 aa  49.3  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>