More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0420 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 215 aa  448  1e-125  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  89.66 
 
 		 203 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  45.77 
 
 		 203 aa  197  1.0000000000000001e-49  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  42.93 
 
 		 203 aa  176  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 207 aa  128  6e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  31.82 
 
 		 204 aa  98.6  7e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 200 aa  98.6  7e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  36.02 
 
 		 207 aa  95.1  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  27.03 
 
 		 307 aa  94.4  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 248 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 333 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  30.2 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  29.26 
 
 		 257 aa  91.7  8e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 224 aa  90.1  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 231 aa  89.4  4e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 215 aa  87.8  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  32.9 
 
 		 203 aa  87.8  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  25.27 
 
 		 205 aa  87.4  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 210 aa  83.2  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  25.97 
 
 		 202 aa  75.9  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 203 aa  76.3  0.0000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 208 aa  75.1  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  28.74 
 
 		 197 aa  73.6  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5392  transcriptional regulator, TetR family protein  29.63 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 		 214 aa  73.2  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  29.38 
 
 		 221 aa  72  0.000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  26.29 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  28.41 
 
 		 222 aa  68.6  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  25.6 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  27.43 
 
 		 199 aa  68.2  0.00000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  29.09 
 
 		 207 aa  68.2  0.00000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  26.16 
 
 		 197 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  29.63 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 232 aa  67  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  24.86 
 
 		 184 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 217 aa  66.2  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 226 aa  65.5  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 212 aa  65.9  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2695  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 		 185 aa  65.1  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000333836  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  23.88 
 
 		 196 aa  63.9  0.000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  28.02 
 
 		 295 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 204 aa  62.8  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  24.88 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  24.27 
 
 		 238 aa  62.4  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  27.98 
 
 		 208 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 241 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  26.59 
 
 		 197 aa  62  0.000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 204 aa  61.2  0.00000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  23.89 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  25.93 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1586  transcriptional regulator, TetR family  32.67 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.66794  normal  0.155541 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0242  transcriptional regulator, TetR family  26.26 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  24.56 
 
 		 216 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 211 aa  60.1  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  24.44 
 
 		 199 aa  60.1  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  26.09 
 
 		 230 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 219 aa  59.7  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  26.71 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3620  TetR family transcriptional regulator  25.94 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.41 
 
 		 229 aa  58.9  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  27.11 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  25.29 
 
 		 193 aa  58.5  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 206 aa  58.2  0.00000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 196 aa  58.2  0.00000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  23.49 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2778  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 205 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 197 aa  57.8  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1265  transcriptional regulator, TetR family  27.13 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0071426 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2175  TetR family transcriptional regulator  30.63 
 
 		 218 aa  57  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  25 
 
 		 214 aa  57  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0930  transcriptional regulator, TetR family  28.71 
 
 		 194 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4295  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  28.33 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1574  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  decreased coverage  0.00597987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02513  transcriptional regulator, TetR family protein  25.32 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  25.42 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  25.61 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 215 aa  56.2  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  23.86 
 
 		 197 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  27.43 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.38 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0199  transcriptional regulator, TetR family  27.23 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.251087  normal  0.943452 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3860  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 203 aa  55.8  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.526451  normal  0.667209 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1838  TetR family transcriptional regulator  23.35 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3297  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 98 aa  54.3  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.368335  normal  0.535572 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  26.71 
 
 		 209 aa  54.7  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4491  transcriptional regulator, TetR family  25.45 
 
 		 209 aa  54.3  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.573623 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  25.71 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0594  TetR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 208 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 195 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6030  transcriptional regulator TetR family  28.97 
 
 		 222 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0410  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 245 aa  53.5  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.560758  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0542  nucleoid occlusion protein  29.52 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  25.42 
 
 		 233 aa  53.5  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0557  TetR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 297 aa  53.9  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5132  transcriptional regulator, TetR family  22.95 
 
 		 211 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.60522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1821  transcriptional regulator, TetR family  38.98 
 
 		 212 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>