More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3010 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 196 aa  389  1e-107  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  45.98 
 
 		 209 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 208 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 201 aa  105  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  37.79 
 
 		 199 aa  100  1e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  39.51 
 
 		 207 aa  95.9  4e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 223 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  30.64 
 
 		 204 aa  82.4  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  36.97 
 
 		 196 aa  77.4  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  38.69 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.75 
 
 		 202 aa  75.5  0.0000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 207 aa  74.7  0.0000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 200 aa  74.3  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 203 aa  73.2  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  32.57 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 		 206 aa  71.6  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  33.94 
 
 		 215 aa  71.2  0.000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.8 
 
 		 229 aa  70.9  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  26.75 
 
 		 203 aa  70.9  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 206 aa  71.2  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  33.54 
 
 		 208 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 216 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 212 aa  69.7  0.00000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  36.25 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  32.52 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  34.68 
 
 		 206 aa  68.6  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 237 aa  68.2  0.00000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  35.71 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  33.54 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0420  TetR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 215 aa  67.4  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1425  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 208 aa  67.8  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3546  TetR family transcriptional regulator  28.82 
 
 		 203 aa  66.6  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 224 aa  66.6  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 222 aa  66.6  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 231 aa  66.6  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 191 aa  66.2  0.0000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1375  regulatory protein TetR  27.61 
 
 		 199 aa  66.2  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.852149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 		 223 aa  66.2  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 230 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 211 aa  65.1  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  29.76 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 222 aa  64.7  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  29.59 
 
 		 248 aa  64.7  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 229 aa  64.7  0.0000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.14 
 
 		 214 aa  64.7  0.0000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  31.29 
 
 		 224 aa  64.3  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  32.93 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5283  transcriptional regulator, TetR family  30.38 
 
 		 184 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.729406  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.54 
 
 		 190 aa  64.3  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  31.18 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 236 aa  63.5  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3414  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 226 aa  63.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0624049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  21.89 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 244 aa  62.8  0.000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0302  putative transcriptional regulator, TetR family  30.54 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.475945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  34.1 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  32.73 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0655  TetR family transcriptional regulator  27.51 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4083  transcriptional regulator, TetR family  27.06 
 
 		 203 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 207 aa  62  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  35.1 
 
 		 206 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.06 
 
 		 204 aa  62  0.000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0670  transcriptional regulator, TetR family  29.01 
 
 		 227 aa  61.6  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.591564 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  31.07 
 
 		 197 aa  61.2  0.000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  30.97 
 
 		 205 aa  61.2  0.000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 218 aa  61.2  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  31.4 
 
 		 226 aa  61.2  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  32.3 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  31.06 
 
 		 234 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 180 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  27.54 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0170  TetR family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 203 aa  60.8  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  31.93 
 
 		 241 aa  60.8  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  26.96 
 
 		 307 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 235 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  32.1 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  31.85 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2636  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  27.84 
 
 		 192 aa  59.7  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00482  NADH dehydrogenase  37.93 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  23.75 
 
 		 175 aa  59.7  0.00000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2330  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 		 225 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.389066  normal  0.980038 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2681  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.160159 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  32.1 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2665  TetR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 196 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  27.95 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0193  TetR family transcriptional regulator  27.17 
 
 		 203 aa  59.7  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25800  TetR family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 212 aa  59.3  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.2464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>