More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5623 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 180 aa  353  1e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  36.42 
 
 		 203 aa  79  0.00000000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 200 aa  72.8  0.000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  34.81 
 
 		 212 aa  72.4  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 208 aa  71.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  37.25 
 
 		 201 aa  70.9  0.000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  34.54 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0395  transcriptional regulator  26.99 
 
 		 175 aa  66.2  0.0000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  35.75 
 
 		 195 aa  64.3  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  34.64 
 
 		 190 aa  63.5  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  26.95 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  33.65 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 224 aa  62.4  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 199 aa  62  0.000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37010  transcriptional regulator  33.89 
 
 		 195 aa  61.2  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.545642 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  32.42 
 
 		 196 aa  61.2  0.000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.61 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5105  transcriptional regulator, TetR family  33.72 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 194 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  31.9 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  35.64 
 
 		 203 aa  59.3  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  41.03 
 
 		 207 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  29.07 
 
 		 181 aa  58.5  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  40.34 
 
 		 206 aa  58.9  0.00000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 		 191 aa  58.2  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  38 
 
 		 211 aa  58.2  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 186 aa  57.8  0.00000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2260  regulatory protein TetR  24.58 
 
 		 199 aa  57.8  0.00000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.535255  normal  0.350629 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  39.5 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  39.6 
 
 		 208 aa  57  0.0000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.17 
 
 		 206 aa  57.4  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 224 aa  57  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  32.07 
 
 		 204 aa  56.6  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  31.15 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3944  putative transcriptional regulator, TetR family  30.47 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000137534  hitchhiker  0.00939559 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  30.12 
 
 		 295 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  31.45 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 247 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  30.91 
 
 		 206 aa  54.7  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 202 aa  54.3  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 240 aa  54.3  0.0000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  26.32 
 
 		 244 aa  53.5  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  32.89 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 206 aa  53.9  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  32.04 
 
 		 236 aa  53.1  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  28.79 
 
 		 200 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 242 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 257 aa  52.4  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  35.24 
 
 		 222 aa  52.4  0.000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 217 aa  52.4  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35780  TetR family regulatory protein  28.82 
 
 		 205 aa  51.6  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2346  hypothetical protein  30 
 
 		 217 aa  52  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  41.11 
 
 		 184 aa  52  0.000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 199 aa  51.6  0.000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05790  transcriptional regulator  28.18 
 
 		 215 aa  51.6  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.415819 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 236 aa  51.2  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  26.37 
 
 		 234 aa  51.2  0.000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.72 
 
 		 230 aa  50.8  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2970  putative transcriptional regulator  29.47 
 
 		 196 aa  51.2  0.000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0889426  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  29.17 
 
 		 225 aa  50.8  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  31.49 
 
 		 237 aa  50.4  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0578  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 267 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51850  Transcriptional regulatory protein, TetR family  36.54 
 
 		 186 aa  50.4  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 222 aa  50.4  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  28.69 
 
 		 192 aa  50.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4672  TetR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 224 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.959951  normal  0.170381 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  27.71 
 
 		 202 aa  50.8  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  32.11 
 
 		 211 aa  50.8  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 193 aa  50.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2082  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 225 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0421  transcriptional regulator, TetR family  36.78 
 
 		 198 aa  49.7  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 		 235 aa  50.1  0.00002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  30.41 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3147  regulatory protein TetR  29.34 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35210  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 		 196 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.831854 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2683  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 218 aa  49.7  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 217 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 203 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 224 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  27.11 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2596  transcriptional regulator, TetR family  38.2 
 
 		 221 aa  49.7  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.269859  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  30.69 
 
 		 307 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 212 aa  49.3  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1397  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.515474  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  27.68 
 
 		 216 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  29.8 
 
 		 223 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1415  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 184 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4615  TetR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 225 aa  49.3  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1451  TetR family transcriptional regulator  28.3 
 
 		 224 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 333 aa  48.5  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 243 aa  48.9  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  28.75 
 
 		 228 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>