266 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_1422 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 
223 aa  440  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  79.71 
 
 
225 aa  308  5e-83  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  45.78 
 
 
181 aa  110  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  38.02 
 
 
184 aa  104  1e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
184 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
184 aa  103  2e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 
188 aa  102  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  40.8 
 
 
206 aa  99.8  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  38.39 
 
 
203 aa  99.8  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  37.43 
 
 
206 aa  98.6  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  38.46 
 
 
240 aa  95.1  7e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  38.17 
 
 
192 aa  92.8  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 
236 aa  92.4  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  37.04 
 
 
193 aa  92.4  5e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  42.67 
 
 
209 aa  92  6e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 
222 aa  88.2  8e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  37.29 
 
 
212 aa  87.4  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 
199 aa  85.5  6e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5643  putative TetR family transcriptional regulator  37.27 
 
 
232 aa  84.3  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.375487 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  35.32 
 
 
203 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  36.41 
 
 
191 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  36.46 
 
 
190 aa  79.3  0.00000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  36.25 
 
 
194 aa  77.4  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
204 aa  76.6  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1537  TetR family transcriptional regulator  38.85 
 
 
247 aa  75.5  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.313453  normal  0.341232 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  36.36 
 
 
189 aa  73.6  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  38.41 
 
 
211 aa  72.8  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  34.52 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  29.47 
 
 
200 aa  72  0.000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30.9 
 
 
203 aa  71.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  37.28 
 
 
207 aa  70.9  0.00000000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  28.42 
 
 
208 aa  70.9  0.00000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.59 
 
 
196 aa  71.2  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  45.37 
 
 
244 aa  70.9  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
220 aa  69.7  0.00000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  28.87 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  33.52 
 
 
196 aa  68.9  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.72 
 
 
214 aa  68.9  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
208 aa  68.2  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  35.33 
 
 
236 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  39.22 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  34.43 
 
 
216 aa  67.4  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
222 aa  66.6  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
237 aa  65.9  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.81 
 
 
208 aa  66.2  0.0000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  26.49 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  30.81 
 
 
228 aa  65.5  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 
191 aa  65.1  0.0000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  33.89 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.59 
 
 
216 aa  65.1  0.0000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  31.72 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 
204 aa  64.7  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 
204 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  31.98 
 
 
234 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 
206 aa  63.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  43.14 
 
 
211 aa  63.5  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
225 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  30.05 
 
 
196 aa  63.2  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 
222 aa  62.4  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 
208 aa  62.4  0.000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
186 aa  62.4  0.000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
200 aa  62.4  0.000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4924  TetR family transcriptional regulator  42.61 
 
 
216 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0122195 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  32.45 
 
 
212 aa  60.8  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  30.36 
 
 
230 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  33.12 
 
 
234 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1611  regulatory protein TetR  33.65 
 
 
222 aa  60.5  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.993172  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 
204 aa  60.1  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  32.74 
 
 
234 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  33.15 
 
 
211 aa  60.1  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0292147 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  34.46 
 
 
241 aa  59.7  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  35.09 
 
 
242 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  32.53 
 
 
195 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  30.49 
 
 
224 aa  58.9  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  32.77 
 
 
206 aa  58.9  0.00000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  32.93 
 
 
235 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
214 aa  58.5  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  26.79 
 
 
224 aa  58.2  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 
208 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal 
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 
231 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 
233 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  26.92 
 
 
229 aa  56.2  0.0000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  34.09 
 
 
230 aa  56.6  0.0000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 
201 aa  56.6  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  31.21 
 
 
231 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 
219 aa  56.2  0.0000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 
235 aa  55.8  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
209 aa  55.8  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  27.72 
 
 
196 aa  55.5  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0782  transcriptional regulator, TetR family  28.87 
 
 
295 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.876045  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4429  TetR family transcriptional regulator  25.14 
 
 
192 aa  55.1  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.247191  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 
244 aa  55.1  0.0000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>