More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5863 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 222 aa  428  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013947  Snas_3222  transcriptional regulator, TetR family  60.2 
 
 		 204 aa  233  1.0000000000000001e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.067896  hitchhiker  0.00000207795 
 
 
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NC_014210  Ndas_2105  transcriptional regulator, TetR family  60.1 
 
 		 202 aa  218  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.143952  normal  1 
 
 
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NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  49.1 
 
 		 194 aa  133  3e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  38.33 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  31.44 
 
 		 204 aa  100  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
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NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  41.27 
 
 		 202 aa  100  2e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  35.18 
 
 		 217 aa  94.4  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 199 aa  92.4  5e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6042  TetR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 217 aa  90.9  1e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0589764 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  31.77 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  36.47 
 
 		 203 aa  88.6  6e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  39.78 
 
 		 207 aa  88.2  9e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  40.12 
 
 		 190 aa  87.8  1e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  40.85 
 
 		 181 aa  86.7  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 234 aa  87  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0778  TetR family transcriptional regulator  46.36 
 
 		 200 aa  85.5  5e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 208 aa  85.9  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 200 aa  85.1  7e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
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NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 184 aa  84.3  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
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NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 184 aa  84.7  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
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NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 208 aa  83.6  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  44.34 
 
 		 240 aa  83.6  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  35.45 
 
 		 193 aa  82.8  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008048  Sala_1696  TetR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 202 aa  82.8  0.000000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.176236  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  48.62 
 
 		 206 aa  82.4  0.000000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
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NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  46.09 
 
 		 206 aa  82  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
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NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 192 aa  81.3  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0895  TetR family transcriptional regulator  39.71 
 
 		 242 aa  80.5  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  35.61 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 211 aa  79.3  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
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NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 222 aa  79  0.00000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
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NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 222 aa  78.6  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
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NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  41.67 
 
 		 206 aa  77.8  0.0000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
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NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  36.84 
 
 		 212 aa  76.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
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NC_010676  Bphyt_4167  transcriptional regulator, TetR family  43.93 
 
 		 244 aa  76.6  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.570017  normal  0.0286956 
 
 
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NC_009484  Acry_3038  TetR family transcriptional regulator  37.24 
 
 		 186 aa  76.3  0.0000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.815569  n/a   
 
 
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NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  42.73 
 
 		 236 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
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NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  36.76 
 
 		 195 aa  76.3  0.0000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
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NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  37.9 
 
 		 236 aa  75.1  0.0000000000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
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NC_007794  Saro_0784  TetR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.42035  n/a   
 
 
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NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  42.06 
 
 		 204 aa  73.6  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
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NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  42.59 
 
 		 237 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  35.98 
 
 		 191 aa  73.6  0.000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
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NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  44.55 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007948  Bpro_3824  TetR family transcriptional regulator  41.9 
 
 		 234 aa  72.8  0.000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 239 aa  72.8  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
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NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
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NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  34.44 
 
 		 199 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 189 aa  71.6  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
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NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  30.6 
 
 		 200 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
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NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  40.74 
 
 		 234 aa  70.1  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 208 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
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NC_012669  Bcav_0283  transcriptional regulator, TetR family  43.75 
 
 		 211 aa  70.1  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0292147 
 
 
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NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  35.06 
 
 		 216 aa  69.7  0.00000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
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NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  31.22 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
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NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  28.83 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
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NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  35.67 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  36.46 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
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NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  32.22 
 
 		 214 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
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NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  30.85 
 
 		 235 aa  68.9  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
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NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  42.2 
 
 		 211 aa  68.6  0.00000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
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NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  34.71 
 
 		 228 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2974  TetR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0060  TetR family transcriptional regulator  35.67 
 
 		 247 aa  68.2  0.00000000009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  43.4 
 
 		 200 aa  67  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0090  transcriptional regulator, TetR family  34.1 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  30.89 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 208 aa  65.9  0.0000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  27.16 
 
 		 202 aa  65.1  0.0000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  30.61 
 
 		 196 aa  65.1  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  34.39 
 
 		 197 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0043  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.343495  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  30.63 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  41.51 
 
 		 150 aa  63.9  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 219 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0788  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.285865  hitchhiker  0.00465255 
 
 
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NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  42.16 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  36.22 
 
 		 180 aa  62  0.000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
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NC_013093  Amir_2244  transcriptional regulator, TetR family  52 
 
 		 197 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000061933  n/a   
 
 
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NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  27.98 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_0845  regulatory protein, TetR  44.86 
 
 		 188 aa  61.6  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.864607  normal  0.151441 
 
 
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NC_013172  Bfae_00920  transcriptional regulator, tetR family  36.23 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  33.71 
 
 		 218 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  45.83 
 
 		 203 aa  60.5  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 197 aa  60.8  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  28.32 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
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NC_013131  Caci_3274  transcriptional regulator, TetR family  33.14 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.570938  normal  1 
 
 
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NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  33.54 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009921  Franean1_4924  TetR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 216 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0122195 
 
 
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NC_009341  Mflv_5603  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.011293  n/a   
 
 
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NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
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NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.35 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
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