More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A0641 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 208 aa  423  1e-118  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  91.39 
 
 		 209 aa  359  2e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 199 aa  134  9.999999999999999e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  43.68 
 
 		 196 aa  125  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  41.14 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.44 
 
 		 203 aa  87.4  1e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 215 aa  84.7  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2722  TetR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 237 aa  78.6  0.00000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 236 aa  73.9  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 184 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1618  TetR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 193 aa  73.2  0.000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  32.57 
 
 		 184 aa  72.8  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4758  TetR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3070  TetR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 211 aa  72  0.000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.519807  normal  0.499995 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  29.65 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.31 
 
 		 203 aa  70.1  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1304  transcriptional regulator, TetR family  35.48 
 
 		 234 aa  67.4  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 239 aa  67.4  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  36 
 
 		 193 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4154  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 234 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0726195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  32.42 
 
 		 216 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  34.59 
 
 		 222 aa  67  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3579  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 		 202 aa  67  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  30.39 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  20.12 
 
 		 205 aa  64.7  0.0000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1805  TetR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 235 aa  63.5  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.604953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0764  TetR family transcriptional regulator  24.28 
 
 		 203 aa  63.9  0.000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0005262  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  27.87 
 
 		 223 aa  63.9  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4250  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 194 aa  63.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.229004  normal  0.19782 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1227  transcriptional regulator, TetR family  39.56 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.43068  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  27.38 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.07 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1032  transcriptional regulator, TetR family  35.17 
 
 		 207 aa  62.8  0.000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6137  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 196 aa  63.2  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.780623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  30.72 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1098  regulatory protein TetR  39.56 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.171966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  31.69 
 
 		 221 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 230 aa  62  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  23.31 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  30.39 
 
 		 228 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 200 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  29.83 
 
 		 208 aa  60.8  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 192 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5863  transcriptional regulator, TetR family  32.5 
 
 		 222 aa  61.2  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  30.41 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  30.23 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  33.56 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  29.68 
 
 		 224 aa  60.5  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 229 aa  59.7  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 219 aa  58.9  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  31.75 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  28.19 
 
 		 211 aa  58.5  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  29.35 
 
 		 210 aa  58.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3021  TetR family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 226 aa  58.2  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1943  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23170  transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 206 aa  57.8  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.946487  normal  0.100375 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  28.32 
 
 		 221 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  33.13 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  27.1 
 
 		 203 aa  57.8  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2896  TetR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 150 aa  57.4  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000335686 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  30.22 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3538  regulatory protein, TetR  27.33 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0647727 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  31.18 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.65 
 
 		 206 aa  56.2  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0440  TetR/AcrR family transcriptional regulator  25.58 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  30.49 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2424  TetR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 195 aa  55.8  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.351018  normal  0.169274 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  26.7 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 207 aa  55.8  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3626  transcriptional regulator, TetR family  30.53 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 181 aa  55.5  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  24.62 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2214  transcriptional regulator, TetR family  29.49 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0668  TetR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.109249  normal  0.847152 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5718  transcriptional regulator, TetR family  28.92 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.283499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  29.03 
 
 		 205 aa  55.1  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.89 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  30.07 
 
 		 208 aa  54.3  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  25.28 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  27.56 
 
 		 207 aa  54.3  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 212 aa  54.3  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  30.64 
 
 		 206 aa  54.7  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  29.53 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 217 aa  53.5  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2450  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 213 aa  53.1  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 257 aa  53.1  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  29.89 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  24.42 
 
 		 204 aa  52.4  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2319  putative transcriptional regulator, TetR family  30.85 
 
 		 236 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5162  transcriptional regulator, TetR family  28.67 
 
 		 193 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.134912  normal  0.642196 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 248 aa  52.4  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0580  TetR family transcriptional regulator  27.65 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.431523 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  26.29 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4723  TetR family transcriptional regulator  28.48 
 
 		 230 aa  51.6  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72626  normal  0.852816 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  21.39 
 
 		 204 aa  52  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1866  transcriptional regulator, TetR family  25.95 
 
 		 199 aa  51.6  0.000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.922935  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  35.48 
 
 		 198 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>