188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4241 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4241  hypothetical protein  100 
 
 		 206 aa  413  9.999999999999999e-116  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.22168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4671  TetR family transcriptional regulator  91.26 
 
 		 206 aa  383  1e-105  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.235627  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0197  putative transcriptional regulator, TetR family  75.61 
 
 		 212 aa  311  2.9999999999999996e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  70.85 
 
 		 221 aa  291  5e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4916  hypothetical protein  59.8 
 
 		 221 aa  190  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195255  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  39.02 
 
 		 243 aa  107  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  38.42 
 
 		 222 aa  105  4e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  38.29 
 
 		 232 aa  97.1  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  37.21 
 
 		 217 aa  97.4  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 230 aa  95.5  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  35.03 
 
 		 229 aa  91.7  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 231 aa  89  4e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  40.59 
 
 		 193 aa  83.2  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 218 aa  83.2  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 212 aa  79.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  32.53 
 
 		 196 aa  76.3  0.0000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 206 aa  74.7  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  35.8 
 
 		 197 aa  74.3  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  32.4 
 
 		 226 aa  70.5  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.87 
 
 		 214 aa  68.2  0.00000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0262  transcriptional regulator, TetR family  38.71 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.670528 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  35.1 
 
 		 196 aa  67  0.0000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 208 aa  65.5  0.0000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 219 aa  65.5  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  25.86 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 209 aa  64.3  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  32.34 
 
 		 203 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2633  transcriptional regulator, TetR family  25.58 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.487613  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  29.19 
 
 		 207 aa  61.6  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  27.85 
 
 		 248 aa  60.8  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  32.28 
 
 		 190 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  29.52 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  34.86 
 
 		 195 aa  59.3  0.00000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 208 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1309  TetR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 222 aa  58.5  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.488116  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  37.11 
 
 		 249 aa  58.5  0.00000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 184 aa  58.5  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  30.43 
 
 		 184 aa  58.2  0.00000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0017  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 235 aa  57.8  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.731504 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  27.44 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  26.54 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  25.29 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  33.1 
 
 		 208 aa  56.2  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3838  transcriptional regulator, TetR family  34.53 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  31.14 
 
 		 203 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2708  regulatory protein TetR  31.62 
 
 		 228 aa  55.5  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.855326  normal  0.333826 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  25.44 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 206 aa  55.5  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0424  TetR family transcriptional regulator  36.15 
 
 		 200 aa  55.1  0.0000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4081  transcriptional regulator, TetR family  33.53 
 
 		 206 aa  54.3  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3204  TetR family transcriptional regulator  33.76 
 
 		 211 aa  54.3  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.109794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0648  AcrR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 167 aa  54.7  0.000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.66521  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  28.99 
 
 		 214 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  24.85 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  31.11 
 
 		 183 aa  53.5  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0017  TetR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 208 aa  53.5  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  32.91 
 
 		 242 aa  53.1  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5623  putative transcriptional regulator, TetR family  28.74 
 
 		 180 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.118423  normal  0.282365 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  26.07 
 
 		 307 aa  52.8  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 333 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  23.81 
 
 		 202 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5135  TetR family transcriptional regulator  31.1 
 
 		 192 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  31.21 
 
 		 191 aa  52  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 216 aa  52  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  31.95 
 
 		 264 aa  51.6  0.000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2935  transcriptional regulator, TetR family  29.7 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.309221  normal  0.0172625 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3020  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 213 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.000370253  normal  0.25528 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2847  TetR family transcriptional regulator  28.18 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0481  transcriptional regulator, TetR family  32.21 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  29.82 
 
 		 230 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0014  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  30.77 
 
 		 212 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  30.46 
 
 		 223 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1643  TetR family transcriptional regulator  26.99 
 
 		 205 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.420046  normal  0.359135 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3318  transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.706239  normal  0.445875 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 242 aa  50.1  0.00003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02070  transcriptional regulator, tetR family  31.76 
 
 		 218 aa  50.1  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  30.06 
 
 		 201 aa  49.7  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1596  hypothetical protein  28.92 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0318645  normal  0.570188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  29.41 
 
 		 247 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7086  transcriptional regulator TetR family  29.17 
 
 		 241 aa  49.3  0.00004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.546749  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0252  transcriptional regulator  29.11 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7473  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  30.57 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3105  TetR family transcriptional regulator  30.38 
 
 		 220 aa  48.9  0.00005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0790075  normal  0.372854 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21120  transcriptional regulator  26.38 
 
 		 203 aa  48.9  0.00005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  26.78 
 
 		 199 aa  48.5  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 222 aa  48.9  0.00006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  31.67 
 
 		 189 aa  48.5  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  23.57 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 256 aa  48.1  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5678  TetR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>