More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_4005 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 242 aa  489  1e-137  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  93.31 
 
 		 242 aa  428  1e-119  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  39.92 
 
 		 264 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  38.94 
 
 		 247 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  37.78 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  38.67 
 
 		 256 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  35.9 
 
 		 249 aa  129  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  36.05 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 234 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 239 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  34.81 
 
 		 243 aa  91.3  1e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 191 aa  82  0.000000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2996  TetR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 193 aa  62  0.000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.542374  normal  0.411304 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  29.19 
 
 		 207 aa  61.6  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  33.86 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  34.26 
 
 		 218 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2271  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.850012 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2327  TetR family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2358  transcriptional regulator, TetR family  30.41 
 
 		 216 aa  59.3  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0281012 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  58.9  0.00000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  30.28 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 204 aa  57.8  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4558  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4523  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.382743 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4646  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.874384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 231 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4941  TetR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.155489 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  34.02 
 
 		 206 aa  56.6  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  30.26 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  34.02 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 234 aa  57  0.0000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0677  transcriptional regulator, TetR family  34.16 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5132  transcriptional regulator, TetR family  31.25 
 
 		 214 aa  56.2  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.493019  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0817  TetR family transcriptional regulator  46.43 
 
 		 212 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3205  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  35.29 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3267  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3216  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 197 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.278224  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  35.92 
 
 		 191 aa  55.5  0.0000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1777  regulatory protein, TetR  34.48 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.26768  normal  0.308935 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5083  regulatory protein TetR  35.09 
 
 		 184 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.749425  normal  0.163121 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  32.05 
 
 		 203 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  28.57 
 
 		 207 aa  55.1  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  32.35 
 
 		 212 aa  54.7  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1398  TetR family transcriptional regulator  26.35 
 
 		 191 aa  55.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2666  TetR family transcriptional regulator  45 
 
 		 213 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 209 aa  54.3  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  31.2 
 
 		 237 aa  53.9  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1422  transcriptional regulator, TetR family  34.86 
 
 		 223 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  31.96 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  29.33 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  32.28 
 
 		 195 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3698  transcriptional regulator, TetR family  33.33 
 
 		 202 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30260  transcriptional regulator  39.62 
 
 		 400 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.473296 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 		 192 aa  53.9  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  32.11 
 
 		 225 aa  53.5  0.000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 220 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  34.23 
 
 		 195 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2800  TetR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 224 aa  53.1  0.000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.697977  decreased coverage  0.000162176 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  32.61 
 
 		 200 aa  52.8  0.000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 278 aa  53.1  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1173  TetR family transcriptional regulator  25.15 
 
 		 189 aa  53.1  0.000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20070  transcriptional regulator, TetR family  23.49 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  32.69 
 
 		 208 aa  52.8  0.000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  34.69 
 
 		 207 aa  52.8  0.000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2767  TetR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0855812  normal  0.684751 
 
 
-
 
NC_004310  BR0280  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.980178  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0294  TetR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.136884  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  34.45 
 
 		 195 aa  52.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 230 aa  52.4  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  25.83 
 
 		 224 aa  52.4  0.000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0336  transcriptional regulator, TetR family  26.47 
 
 		 191 aa  52  0.000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.510139 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0765  TetR family transcriptional regulator  40 
 
 		 228 aa  52  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4505  regulatory protein TetR  36.96 
 
 		 390 aa  52  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.215764  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1856  transcriptional regulator, TetR family  35.64 
 
 		 222 aa  52  0.000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.906441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0175  TetR family transcriptional regulator  32.31 
 
 		 203 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3312  transcriptional regulator UidR  40.74 
 
 		 198 aa  51.6  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2601  regulatory protein, TetR  39.13 
 
 		 224 aa  51.6  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.354794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1191  TetR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 219 aa  51.6  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00105223  normal  0.516093 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2248  TetR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 222 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0660336  normal  0.0152181 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2830  transcriptional regulator, TetR family  28.48 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.514088 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  34.31 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 197 aa  51.6  0.00001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4074  TetR family transcriptional regulator  31.76 
 
 		 194 aa  52  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.137574 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4006  transcriptional regulator, TetR family  48.89 
 
 		 202 aa  50.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  42.59 
 
 		 203 aa  51.2  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4773  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 		 212 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000164473  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  28.26 
 
 		 223 aa  50.8  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3220  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.626936  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3231  TetR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.140653  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>