More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1892 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 243 aa  474  1e-133  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  47.27 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  48.47 
 
 		 243 aa  169  5e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  47.46 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  40.34 
 
 		 249 aa  144  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  40.53 
 
 		 247 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  35.06 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  31.8 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  30.52 
 
 		 242 aa  96.3  4e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  37.67 
 
 		 191 aa  88.6  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  35.27 
 
 		 234 aa  84.3  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  36.15 
 
 		 212 aa  66.2  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  31.95 
 
 		 206 aa  65.5  0.0000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 218 aa  65.1  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1076  TetR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 196 aa  61.6  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.581791 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0354  TetR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 214 aa  60.1  0.00000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.774788 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0810  transcriptional regulator  32.14 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.490663  normal  0.19914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2604  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 195 aa  59.7  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  35.2 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2597  putative transcriptional regulator, TetR family  39.22 
 
 		 195 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.607466 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  31.96 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  30.19 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0619  transcriptional regulator, TetR family  34.19 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0692  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 193 aa  56.6  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.253039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2575  transcriptional regulator, TetR family  38.75 
 
 		 183 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  32.61 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0910  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.843959  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0633  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0676  TetR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 193 aa  56.2  0.0000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0323458  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0735  regulatory protein, TetR  33.53 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  34.58 
 
 		 196 aa  55.1  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2746  transcriptional regulator, TetR family  34.78 
 
 		 201 aa  54.7  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00523  transcriptional regulator, TetR family protein  30.33 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1597  transcriptional regulator, TetR family  34.56 
 
 		 187 aa  53.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0577868  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25080  Transcriptional regulator, TetR family  32.31 
 
 		 191 aa  53.1  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  35.35 
 
 		 197 aa  53.1  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2434  TetR family transcriptional regulator  39.19 
 
 		 188 aa  53.1  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0740  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 205 aa  52.8  0.000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.891023  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  29.45 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1516  transcriptional regulator, TetR family  36.49 
 
 		 203 aa  52.8  0.000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3060  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 		 203 aa  52.4  0.000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 198 aa  52.4  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6886  TetR family transcriptional regulator  33.63 
 
 		 239 aa  52  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0975429  normal  0.0518769 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0167  transcriptional regulator, TetR family  40.28 
 
 		 200 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3937  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 187 aa  50.8  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00797355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2610  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.965658  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2654  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.569555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 206 aa  50.8  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2640  TetR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 207 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0402  TetR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 196 aa  50.4  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.498778  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0152  tetracycline repressor protein, class A  39.13 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 333 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3517  TetR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0435497  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0351  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01162  transcription regulator, TetR family protein  29 
 
 		 201 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2611  TetR family transcriptional regulator  28.8 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.620771 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1971  transcriptional regulator, TetR family  44.83 
 
 		 196 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0033  tetracycline repressor protein, class A  39.13 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.370137  normal  0.333737 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0043  tetracycline repressor protein R, class A  39.13 
 
 		 225 aa  50.4  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5476  TetR family transcriptional regulator  37.37 
 
 		 240 aa  50.4  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1561  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 219 aa  49.7  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7950  putative transcriptional regulator, TetR family  32.32 
 
 		 218 aa  49.7  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0296  transcriptional regulator, TetR family  40 
 
 		 216 aa  49.7  0.00004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2511  transcriptional regulator, TetR family  47.06 
 
 		 172 aa  49.7  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0599  TetR family transcriptional regulator  44.12 
 
 		 200 aa  49.3  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.000153581  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  41.82 
 
 		 191 aa  48.9  0.00006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1059  TetR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 217 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5169  TetR family transcriptional regulator  34.83 
 
 		 196 aa  49.3  0.00006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2464  transcriptional regulator, TetR family  30.84 
 
 		 193 aa  49.3  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.943089 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  29.57 
 
 		 307 aa  49.3  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4369  TetR family transcriptional regulator  48.28 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0876  TetR family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 226 aa  48.9  0.00007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.140831 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0999  transcriptional regulator, TetR family  23.64 
 
 		 204 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.372995  normal  0.0457994 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1731  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 		 199 aa  48.5  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.206322 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5293  TetR family transcriptional regulator  41.33 
 
 		 210 aa  48.9  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0781  transcriptional regulator, TetR family  35.81 
 
 		 197 aa  48.9  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0809  regulatory protein, TetR  42.86 
 
 		 200 aa  48.9  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2055  TetR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 206 aa  48.5  0.00008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1473  transcriptional regulator, TetR family  31.97 
 
 		 207 aa  48.5  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.245471  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0982  regulatory protein TetR  35.71 
 
 		 188 aa  48.5  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1007  transcription regulator protein  28.57 
 
 		 239 aa  48.1  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.605979  normal  0.178446 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0117  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.678219 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4820  transcriptional regulator, TetR family  27.52 
 
 		 203 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.353068 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0110  transcriptional regulator, TetR family  38.03 
 
 		 225 aa  48.5  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3692  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.674174  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 278 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5717  transcriptional regulator, TetR family  31.31 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.985195 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3267  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 188 aa  48.5  0.0001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  37.14 
 
 		 229 aa  47.8  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
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NC_010552  BamMC406_4165  TetR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 232 aa  47.8  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367589  normal  0.612517 
 
 
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NC_013131  Caci_4359  transcriptional regulator, TetR family  35.23 
 
 		 205 aa  48.1  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23587 
 
 
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NC_010551  BamMC406_0683  TetR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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