281 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_6450 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_6450  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.717411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6157  TetR family transcriptional regulator  98.95 
 
 		 190 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6844  TetR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 203 aa  201  6e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1203  TetR family transcriptional regulator  51.76 
 
 		 203 aa  201  7e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4863  transcriptional regulator, TetR family  31.55 
 
 		 209 aa  83.2  0.000000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4542  transcriptional regulator, TetR family  23.78 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.204937  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1331  transcriptional regulator, TetR family  29.38 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1039  TetR family transcriptional regulator  23.2 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0390412  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3992  transcriptional regulator, TetR family  28.43 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0301  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 199 aa  58.9  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0864199  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  26.53 
 
 		 203 aa  58.9  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3836  transcriptional regulator, TetR family  31.58 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0412  TetR family transcriptional regulator  27.59 
 
 		 216 aa  57.4  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.742667  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0784  transcriptional regulator, TetR family  27.04 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3291  TetR family transcriptional regulator  24.4 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0564  transcriptional regulator, TetR family  28.08 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2974  TetR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6345  transcriptional regulator, TetR family  25.11 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2518  transcriptional regulator, TetR family  29.95 
 
 		 191 aa  54.3  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0208752  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  29.7 
 
 		 234 aa  53.9  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4675  regulatory protein TetR  28.49 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2539  transcriptional regulator, TetR family  26.63 
 
 		 196 aa  53.5  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2314  transcriptional regulator, TetR family  23.12 
 
 		 213 aa  53.5  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.251224 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2233  transcriptional regulator, TetR family  26.13 
 
 		 196 aa  53.1  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.943574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3604  TetR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.461648 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4171  TetR family transcriptional regulator  22.55 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0201849  hitchhiker  0.000462956 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1947  TetR family transcriptional regulator  31.69 
 
 		 197 aa  52.4  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4247  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0639864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4333  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.771402  normal  0.443044 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4626  TetR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.734291 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1405  transcriptional regulator, TetR family  30 
 
 		 212 aa  51.6  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.408275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4581  TetR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0138954  normal  0.0554322 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1336  TetR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 200 aa  51.2  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00010036 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  23.36 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1216  TetR family transcriptional regulator  29.34 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3314  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2436  TetR family transcriptional regulator  46.97 
 
 		 243 aa  51.2  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.747053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2990  TetR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 288 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.989251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1538  TetR family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 222 aa  50.8  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8610  putative transcriptional regulator, TetR family  28.83 
 
 		 317 aa  50.1  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0908  transcriptional regulator, TetR family  29.2 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.469028  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0882  transcriptional regulator, TetR family  23.9 
 
 		 233 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6443  transcriptional regulator, TetR family  26.52 
 
 		 202 aa  50.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  30.98 
 
 		 209 aa  50.1  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5606  putative transcriptional regulator, TetR family  27.39 
 
 		 189 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0377477  normal  0.125627 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  26.06 
 
 		 197 aa  50.4  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3198  TetR family transcriptional regulator  25.36 
 
 		 215 aa  49.7  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00193732  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3984  transcriptional regulator, TetR family  24.16 
 
 		 200 aa  50.1  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.562971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9036  putative transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 214 aa  49.7  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.505167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4304  TetR family transcriptional regulator  24.85 
 
 		 202 aa  49.7  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148025  normal  0.676238 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11037  TetR family transcriptional regulator  29.23 
 
 		 197 aa  49.7  0.00003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.102388  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3444  transcriptional regulator, TetR family  29.76 
 
 		 200 aa  49.3  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.700957 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0707  TetR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  26.7 
 
 		 206 aa  49.3  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3259  transcriptional regulator, TetR family  26.14 
 
 		 219 aa  49.3  0.00004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.147915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0651  TetR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.0025795  normal  0.249536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4061  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 240 aa  48.9  0.00005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3217  transcriptional regulator, TetR family  36.96 
 
 		 207 aa  48.9  0.00005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000141467  hitchhiker  0.00109998 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 231 aa  48.9  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0907  transcriptional regulator, TetR family  25.13 
 
 		 202 aa  48.9  0.00006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2548  TetR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 236 aa  48.9  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000944763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5207  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5295  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.334601  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5587  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.214408 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3791  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 213 aa  48.5  0.00006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.353737  normal  0.906979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3183  transcriptional regulator, TetR family  35.45 
 
 		 220 aa  48.5  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2310  TetR family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 220 aa  48.5  0.00007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.987325  decreased coverage  0.00710043 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4066  transcriptional regulator, TetR family  26.28 
 
 		 211 aa  48.5  0.00007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0641  TetR family transcriptional regulator  26.24 
 
 		 208 aa  48.5  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 207 aa  48.5  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3329  transcriptional regulator, TetR family  22.94 
 
 		 214 aa  48.5  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000330103  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4778  TetR family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 217 aa  48.5  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0477  TetR family transcriptional regulator  25 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.178939  normal  0.0289146 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2650  transcriptional regulator, TetR family  25.88 
 
 		 211 aa  48.1  0.00008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2900  transcriptional regulator, TetR family  26.79 
 
 		 201 aa  48.1  0.00008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1914  transcriptional regulator, TetR family  28.24 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2448  TetR family transcriptional regulator  24.3 
 
 		 204 aa  48.1  0.00009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0199857  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1537  TetR family transcriptional regulator  22.54 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1613  regulatory protein TetR  27.17 
 
 		 221 aa  48.1  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0438  transcriptional regulator, TetR family  30.2 
 
 		 219 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.275927  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4764  transcriptional regulator, TetR family  27.01 
 
 		 181 aa  47.4  0.0001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5096  transcriptional regulator, TetR family  26.97 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841888  normal  0.375957 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2433  TetR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3240  putative transcriptional regulator, TetR family  28.65 
 
 		 201 aa  47.4  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00194759  normal  0.442697 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1289  transcriptional regulator, TetR family  23.32 
 
 		 192 aa  48.1  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4515  transcriptional regulator, TetR family  27.59 
 
 		 217 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.302767  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1314  TetR family transcriptional regulator  21.56 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.6037  normal  0.969851 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1844  transcriptional regulator, TetR family  23.23 
 
 		 214 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  27.36 
 
 		 224 aa  46.6  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0340  transcriptional regulator, TetR family  36.26 
 
 		 388 aa  46.6  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4809  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 213 aa  46.6  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2399  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0736  TetR family transcriptional regulator  25.79 
 
 		 198 aa  47  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3565  transcriptional regulator, TetR family  27.22 
 
 		 191 aa  47  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.534014  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1558  regulatory protein TetR  27.27 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2446  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.200805  normal  0.401008 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2440  TetR family transcriptional regulator  28.9 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7149  transcriptional regulator, TetR family  32.29 
 
 		 224 aa  47  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6393  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 229 aa  47  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0255151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0295  transcriptional regulator, TetR family  27.91 
 
 		 220 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0107513  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>