More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2221 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2221  transcriptional regulator, TetR family  100 
 
 		 264 aa  531  1e-150  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.104647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4942  transcriptional regulator, TetR family  63.82 
 
 		 247 aa  281  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134742  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3140  transcriptional regulator, TetR family  45.3 
 
 		 230 aa  184  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3790  transcriptional regulator, TetR family  39.05 
 
 		 242 aa  159  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4005  TetR family transcriptional regulator  37.96 
 
 		 242 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0547  transcriptional regulator, TetR family  41.63 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1892  TetR family transcriptional regulator  47.46 
 
 		 243 aa  125  9e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.717791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0136  transcriptional regulator, TetR family  38.91 
 
 		 243 aa  118  9.999999999999999e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30147  normal  0.0856805 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0941  TetR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 239 aa  116  5e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3567  transcriptional regulator, TetR family  41.47 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.409379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3310  transcriptional regulator, TetR family  37.83 
 
 		 256 aa  113  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000381613  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0027  TetR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 191 aa  89.7  4e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.192036  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3894  regulatory protein TetR  33.73 
 
 		 206 aa  73.6  0.000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2110  TetR family transcriptional regulator  30.1 
 
 		 218 aa  67  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722857  normal  0.248102 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0325  TetR family transcriptional regulator  40.38 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6363  transcriptional regulator, TetR family  37.37 
 
 		 222 aa  63.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.318357 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6428  transcriptional regulator, TetR family  37.25 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1709  transcriptional regulator, TetR family  34.12 
 
 		 207 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.17641  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3929  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 210 aa  62  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.459326  normal  0.170288 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3613  putative transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 		 221 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1036  TetR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 209 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0478429 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1958  putative transcriptional regulator, TetR family  32.43 
 
 		 208 aa  59.7  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.158698  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3164  transcriptional regulator, TetR family  35.12 
 
 		 208 aa  60.1  0.00000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.859639  normal  0.0513104 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00530  transcriptional regulator  27.4 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1231  transcriptional regulator, TetR family  31.68 
 
 		 212 aa  60.1  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.814793  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6231  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 197 aa  59.7  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2190  TetR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 223 aa  59.3  0.00000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2132  TetR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.273159  normal  0.36697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2496  TetR family transcriptional regulator  35 
 
 		 333 aa  58.9  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5699  TetR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 206 aa  58.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.393579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1384  TetR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 225 aa  58.5  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00670258  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0868  transcriptional regulator, TetR family  34.15 
 
 		 230 aa  58.2  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0030  TetR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.19641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1741  transcriptional regulator, TetR family  34.02 
 
 		 307 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6361  transcriptional regulator, TetR family  34.29 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.529564  normal  0.439154 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1469  transcriptional regulator, TetR family  38.78 
 
 		 197 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4024  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 207 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1369  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 208 aa  57  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4343  regulatory protein TetR  35.05 
 
 		 196 aa  57  0.0000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.817011  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0855  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.835032 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4572  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 234 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224675 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2172  transcriptional regulator, TetR family  31.36 
 
 		 199 aa  56.2  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2726  transcriptional regulator, TetR family  29.26 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544157 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2955  TetR family transcriptional regulator  29.94 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30540  transcriptional regulator, TetR family  32.73 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2591  transcriptional regulator, TetR family  32.38 
 
 		 192 aa  55.5  0.0000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.266738 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05540  transcriptional regulator  32.35 
 
 		 197 aa  55.5  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00759  transcriptional regulator, TetR family protein  29.35 
 
 		 224 aa  55.5  0.0000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2751  putative transcriptional regulator, TetR family  32.12 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0359606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5527  transcriptional regulator, TetR family  30.17 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0516  TetR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 195 aa  55.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3091  TetR family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 224 aa  55.1  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2655  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 226 aa  55.1  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2495  transcriptional regulator, TetR family  33.82 
 
 		 287 aa  54.3  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0937177  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4186  TetR family transcriptional regulator  31.63 
 
 		 195 aa  54.7  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1046  TetR family transcriptional regulator  31.01 
 
 		 201 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4538  putative transcriptional regulator, TetR family  30.28 
 
 		 243 aa  54.3  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.530779  normal  0.432727 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0894  TetR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0749762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2155  TetR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1653  TetR family transcriptional regulator  29.53 
 
 		 248 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0999952  normal  0.0709901 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1166  TetR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 278 aa  53.9  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0604682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10666  TetR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 231 aa  53.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000329516  normal  0.389268 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0024  TetR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 193 aa  53.9  0.000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4105  transcriptional regulator, TetR family  30.99 
 
 		 232 aa  53.9  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4298  TetR family transcriptional regulator  27.35 
 
 		 197 aa  53.5  0.000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3010  transcriptional regulator, TetR family  36.73 
 
 		 196 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.798857 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0439  TetR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3059  TetR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 205 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4112  TetR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 183 aa  53.1  0.000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0592835  normal  0.670519 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1142  transcriptional regulator, TetR family  31.43 
 
 		 260 aa  53.5  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3240  TetR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 209 aa  53.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4464  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3902  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6011  transcriptional regulator, TetR family  32.98 
 
 		 203 aa  53.1  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3625  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 278 aa  53.1  0.000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.662049  normal  0.863638 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0758  transcriptional regulator, TetR family  30.89 
 
 		 229 aa  52.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.685577  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2494  transcriptional regulator, TetR family  38.46 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000125237  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0688  TetR family transcriptional regulator  35.05 
 
 		 206 aa  52.8  0.000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.987458 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1062  TetR family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 215 aa  52.4  0.000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.453034  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3508  regulatory protein, TetR  51.85 
 
 		 200 aa  52.4  0.000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0988004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2233  TetR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 187 aa  52.4  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.749736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3851  TetR family transcriptional regulator  54.9 
 
 		 210 aa  52.4  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.197556  normal  0.870182 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0122  transcriptional regulator, TetR family  37.5 
 
 		 204 aa  52.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.288839  decreased coverage  0.00195597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2190  TetR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 277 aa  52  0.000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.168858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3474  transcriptional regulator of TetR family protein  37.18 
 
 		 191 aa  52  0.000009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.486624 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1768  TetR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 211 aa  52  0.000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.570427  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2223  TetR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 200 aa  52  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.360909  normal  0.0579313 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0279  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0832  transcriptional regulator, TetR family  28.28 
 
 		 196 aa  51.6  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1731  transcriptional regulator, TetR family  35.58 
 
 		 196 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0465827  normal  0.0150851 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1929  TetR family transcriptional regulator  30.66 
 
 		 206 aa  51.6  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0467  TetR family transcriptional regulator  31.46 
 
 		 198 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0763  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.756053  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0906  transcriptional regulator, TetR family  49.15 
 
 		 232 aa  51.6  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.052988  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0927  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 195 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2059  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 173 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.045167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0015  TetR family transcriptional regulator  33 
 
 		 214 aa  51.6  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.576639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0917  TetR family transcriptional regulator  29.1 
 
 		 195 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0208731 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1994  TetR family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 173 aa  51.6  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.187018  normal  0.996586 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0732  TetR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 210 aa  51.6  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>